More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2623 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  76.5 
 
 
533 aa  836    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  64.2 
 
 
539 aa  647    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  60.34 
 
 
568 aa  636    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
533 aa  1080    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  63.45 
 
 
538 aa  634  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  60.04 
 
 
549 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  61.1 
 
 
562 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  58.57 
 
 
532 aa  569  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  55.15 
 
 
541 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  54.78 
 
 
541 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  61.26 
 
 
531 aa  565  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  56.59 
 
 
512 aa  550  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0011  Gamma-glutamyltransferase  57.98 
 
 
531 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  53.02 
 
 
545 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  52.83 
 
 
545 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  52.11 
 
 
529 aa  546  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4154  gamma-glutamyltransferase 2  57.79 
 
 
531 aa  544  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  53.76 
 
 
542 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  53.76 
 
 
542 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  53.02 
 
 
545 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  54.55 
 
 
557 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  54.55 
 
 
557 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  54.36 
 
 
557 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  55.83 
 
 
526 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  54.55 
 
 
557 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  54.55 
 
 
557 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  54.36 
 
 
557 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  54.36 
 
 
557 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  52.55 
 
 
546 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  52.74 
 
 
546 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  52.55 
 
 
546 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  52.55 
 
 
546 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  53.06 
 
 
634 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  54.24 
 
 
543 aa  521  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  52.55 
 
 
546 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  52.19 
 
 
546 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  52.89 
 
 
537 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  52.61 
 
 
539 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  52.74 
 
 
546 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  54.39 
 
 
552 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3055  gamma-glutamyltransferase  53.82 
 
 
541 aa  499  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  53.72 
 
 
539 aa  495  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3878  gamma-glutamyltransferase 2  50.28 
 
 
552 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798637  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  53.4 
 
 
529 aa  491  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  50.19 
 
 
530 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  50.65 
 
 
538 aa  458  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  49.62 
 
 
536 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  49.16 
 
 
536 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  48.22 
 
 
534 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  47.15 
 
 
537 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  49.45 
 
 
538 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  47.96 
 
 
534 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  44.4 
 
 
534 aa  438  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  48.9 
 
 
538 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  48.01 
 
 
535 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  49.07 
 
 
539 aa  428  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  48.64 
 
 
538 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  45.57 
 
 
563 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2624  gamma-glutamyltransferase 2  45.86 
 
 
508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  45.66 
 
 
593 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  48.55 
 
 
531 aa  404  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  44.4 
 
 
564 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  45.27 
 
 
590 aa  392  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  47.07 
 
 
573 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  48.29 
 
 
542 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  38.06 
 
 
539 aa  375  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  49.24 
 
 
542 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  44.27 
 
 
568 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  44.19 
 
 
570 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  44.29 
 
 
543 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  43.84 
 
 
563 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  44.38 
 
 
570 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  44.19 
 
 
570 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  43.62 
 
 
570 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  43.62 
 
 
570 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  43.49 
 
 
579 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  43.24 
 
 
545 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  43.62 
 
 
570 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  43.43 
 
 
570 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  43.43 
 
 
570 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  42.1 
 
 
565 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  41.47 
 
 
561 aa  349  8e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  42.51 
 
 
540 aa  333  5e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  36.38 
 
 
589 aa  328  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  42.91 
 
 
531 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  39.59 
 
 
601 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  37.41 
 
 
592 aa  325  2e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  39.44 
 
 
565 aa  324  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05658  gamma-glutamyltranspeptidase (AFU_orthologue; AFUA_4G13580)  37.63 
 
 
606 aa  323  7e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124875 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  40.22 
 
 
558 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  40.49 
 
 
542 aa  317  4e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  39.37 
 
 
531 aa  317  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  39.43 
 
 
534 aa  316  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  39.09 
 
 
525 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  39.74 
 
 
525 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  38.32 
 
 
527 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1641  gamma-glutamyltransferase 2  42.27 
 
 
542 aa  309  9e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0878  gamma-glutamyltransferase  41.45 
 
 
503 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  37.14 
 
 
529 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  35.71 
 
 
528 aa  301  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>