More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2062 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  99.08 
 
 
546 aa  1102    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  70.17 
 
 
552 aa  738    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  83.06 
 
 
557 aa  905    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  76.19 
 
 
541 aa  850    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  92.67 
 
 
546 aa  1016    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  83.24 
 
 
557 aa  905    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  94.51 
 
 
546 aa  1040    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  83.06 
 
 
557 aa  905    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  78.94 
 
 
545 aa  888    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  72.56 
 
 
542 aa  786    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  83.24 
 
 
557 aa  905    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  81.95 
 
 
634 aa  894    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  61.86 
 
 
543 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3878  gamma-glutamyltransferase 2  63.35 
 
 
552 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798637  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  78.21 
 
 
545 aa  882    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  83.06 
 
 
557 aa  905    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  74.73 
 
 
541 aa  835    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  95.24 
 
 
546 aa  1028    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
546 aa  1111    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  64.29 
 
 
539 aa  674    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  62.75 
 
 
539 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  95.24 
 
 
546 aa  1044    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  83.24 
 
 
557 aa  905    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
546 aa  1111    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  65.75 
 
 
537 aa  683    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  83.06 
 
 
557 aa  905    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  72.74 
 
 
542 aa  786    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  78.02 
 
 
545 aa  864    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3055  gamma-glutamyltransferase  62.41 
 
 
541 aa  619  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  53.36 
 
 
533 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  55.58 
 
 
526 aa  551  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  51.12 
 
 
529 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  52.55 
 
 
533 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  54.34 
 
 
512 aa  532  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  55.33 
 
 
538 aa  533  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  53.1 
 
 
539 aa  527  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  52.21 
 
 
568 aa  521  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  53.31 
 
 
562 aa  495  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  49.72 
 
 
549 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  51.2 
 
 
532 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  51.72 
 
 
536 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4154  gamma-glutamyltransferase 2  53.49 
 
 
531 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  54.81 
 
 
531 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0011  Gamma-glutamyltransferase  52.94 
 
 
531 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  50 
 
 
536 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  49.72 
 
 
529 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  48.71 
 
 
534 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  46.25 
 
 
530 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  48.18 
 
 
535 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  49.17 
 
 
538 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  48.45 
 
 
534 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  47.52 
 
 
538 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  43.57 
 
 
534 aa  422  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  49.17 
 
 
531 aa  413  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  45.99 
 
 
538 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  48.26 
 
 
539 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  43.17 
 
 
537 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  45.44 
 
 
538 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  41.12 
 
 
539 aa  393  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  41.45 
 
 
563 aa  362  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  43.44 
 
 
593 aa  361  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  42.55 
 
 
573 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2624  gamma-glutamyltransferase 2  41.28 
 
 
508 aa  355  8.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  43.2 
 
 
531 aa  353  5e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  39.85 
 
 
561 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  46.1 
 
 
542 aa  346  8e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  46.63 
 
 
542 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  39.61 
 
 
579 aa  344  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  40.76 
 
 
558 aa  343  4e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  40.72 
 
 
590 aa  341  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  40.4 
 
 
545 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  40.29 
 
 
565 aa  339  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  41.61 
 
 
540 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  40.4 
 
 
570 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  40.4 
 
 
570 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  40.4 
 
 
570 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  40.58 
 
 
570 aa  337  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  39.13 
 
 
564 aa  335  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  39.86 
 
 
570 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  40.22 
 
 
570 aa  334  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  39.93 
 
 
568 aa  333  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  39.86 
 
 
570 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  39.86 
 
 
570 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  39.67 
 
 
563 aa  329  6e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  39.49 
 
 
601 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  39.75 
 
 
565 aa  326  5e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  41.75 
 
 
543 aa  323  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  39.44 
 
 
542 aa  323  5e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05658  gamma-glutamyltranspeptidase (AFU_orthologue; AFUA_4G13580)  38.09 
 
 
606 aa  320  6e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124875 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  40.92 
 
 
531 aa  319  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  34.57 
 
 
589 aa  313  3.9999999999999997e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  36.82 
 
 
592 aa  310  4e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  38.28 
 
 
553 aa  310  4e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1641  gamma-glutamyltransferase 2  41.06 
 
 
542 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  37.29 
 
 
529 aa  298  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  34.41 
 
 
528 aa  296  9e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  36.55 
 
 
534 aa  294  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  39.51 
 
 
527 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  38.96 
 
 
525 aa  286  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  36.93 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>