More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0928 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 		 539 aa  1092    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 539 aa  1092    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  48.29 
 
 		 533 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  42.99 
 
 		 532 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  43.7 
 
 		 543 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  44.76 
 
 		 569 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  47.35 
 
 		 532 aa  402  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  44.26 
 
 		 532 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  45.74 
 
 		 536 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  44.89 
 
 		 522 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  44.02 
 
 		 569 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  43.1 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  43.64 
 
 		 538 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  43.73 
 
 		 552 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  44.25 
 
 		 529 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  43.42 
 
 		 531 aa  385  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  45.06 
 
 		 529 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  42.37 
 
 		 528 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  43.94 
 
 		 532 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  46.94 
 
 		 539 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  43.67 
 
 		 528 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  42.94 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  42.24 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  44.42 
 
 		 530 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  43.28 
 
 		 532 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  42.72 
 
 		 550 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  44.07 
 
 		 534 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  43.08 
 
 		 531 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  46.63 
 
 		 528 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  44.32 
 
 		 527 aa  363  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  42.31 
 
 		 550 aa  362  8e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  42.88 
 
 		 625 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  40.07 
 
 		 553 aa  357  3.9999999999999996e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  42.5 
 
 		 531 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  40.95 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  40.08 
 
 		 523 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  40.72 
 
 		 522 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  39.12 
 
 		 543 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  34.91 
 
 		 524 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  37.59 
 
 		 513 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  36.59 
 
 		 526 aa  268  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  34.35 
 
 		 529 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  37.33 
 
 		 568 aa  267  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  33.46 
 
 		 563 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  34.42 
 
 		 533 aa  260  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  34.64 
 
 		 541 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  35.99 
 
 		 546 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  35.9 
 
 		 573 aa  257  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  35.25 
 
 		 557 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  32.26 
 
 		 561 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  35.44 
 
 		 546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  35.44 
 
 		 546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  35.25 
 
 		 557 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  37.22 
 
 		 539 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  35.25 
 
 		 557 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  33.08 
 
 		 568 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  37.5 
 
 		 531 aa  254  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  35.44 
 
 		 546 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  35.25 
 
 		 546 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  33.96 
 
 		 541 aa  253  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  35.06 
 
 		 557 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  36.19 
 
 		 538 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  35.86 
 
 		 538 aa  252  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  35.06 
 
 		 557 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  35.06 
 
 		 557 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  35.06 
 
 		 557 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  35.59 
 
 		 531 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  32.28 
 
 		 534 aa  250  5e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  35.44 
 
 		 546 aa  250  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  34.71 
 
 		 529 aa  249  6e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  35.06 
 
 		 634 aa  249  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  34.38 
 
 		 536 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  33.64 
 
 		 537 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  32.53 
 
 		 529 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 		 535 aa  248  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  33.46 
 
 		 512 aa  247  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  32.78 
 
 		 565 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  36.57 
 
 		 538 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  35.26 
 
 		 527 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  34.01 
 
 		 545 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  29.62 
 
 		 589 aa  244  3e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4079  gamma-glutamyltransferase  32.7 
 
 		 528 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  32.29 
 
 		 564 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  33.03 
 
 		 593 aa  243  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  35.25 
 
 		 546 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  34.87 
 
 		 542 aa  243  7.999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  32.02 
 
 		 590 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  31.21 
 
 		 525 aa  242  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  34.29 
 
 		 533 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  32.91 
 
 		 570 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  34.4 
 
 		 542 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  32.91 
 
 		 570 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  32.2 
 
 		 541 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  32.97 
 
 		 545 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  34.85 
 
 		 536 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  32.79 
 
 		 558 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  35.73 
 
 		 562 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  32.73 
 
 		 570 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  33.46 
 
 		 545 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  33.71 
 
 		 545 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>