More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3809 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  63.76 
 
 		 543 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 532 aa  1064    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  65.01 
 
 		 522 aa  628  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  63.14 
 
 		 532 aa  627  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  57.46 
 
 		 529 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  56.72 
 
 		 531 aa  535  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  56.47 
 
 		 528 aa  535  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  56.37 
 
 		 529 aa  532  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  59.78 
 
 		 528 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  54.94 
 
 		 533 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  52.16 
 
 		 532 aa  503  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  52.53 
 
 		 530 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  51.78 
 
 		 550 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  52.48 
 
 		 532 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  52.32 
 
 		 539 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  50.84 
 
 		 534 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  50.77 
 
 		 532 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  51.12 
 
 		 527 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  48.67 
 
 		 531 aa  458  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  49.7 
 
 		 531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  49.9 
 
 		 531 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  50.1 
 
 		 625 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  47.12 
 
 		 528 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  47.35 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  46.54 
 
 		 550 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  47.35 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  48.57 
 
 		 536 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  47.88 
 
 		 525 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  47.57 
 
 		 523 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  47.32 
 
 		 522 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  42.02 
 
 		 528 aa  362  9e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  43.78 
 
 		 552 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  41.5 
 
 		 553 aa  349  6e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  41.22 
 
 		 569 aa  333  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  40.27 
 
 		 540 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  39.58 
 
 		 569 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  39.58 
 
 		 538 aa  325  9e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  37.03 
 
 		 524 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  35.51 
 
 		 513 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  37.69 
 
 		 512 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  40.49 
 
 		 538 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  40.5 
 
 		 562 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  39.74 
 
 		 568 aa  283  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  38.93 
 
 		 557 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  38.27 
 
 		 538 aa  281  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  38.93 
 
 		 557 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  38.93 
 
 		 557 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  38.75 
 
 		 557 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  38.75 
 
 		 557 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  38.75 
 
 		 557 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  38.75 
 
 		 557 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  39.88 
 
 		 634 aa  277  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  38.22 
 
 		 545 aa  276  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  39.14 
 
 		 539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  36.62 
 
 		 533 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  38.58 
 
 		 549 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  37.43 
 
 		 526 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  37.29 
 
 		 543 aa  270  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  39.01 
 
 		 546 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  36.28 
 
 		 533 aa  269  8e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  36.8 
 
 		 542 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  35.83 
 
 		 529 aa  269  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  37.62 
 
 		 545 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  36.21 
 
 		 534 aa  267  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  36.52 
 
 		 537 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  34.64 
 
 		 537 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  38.54 
 
 		 546 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  35.93 
 
 		 539 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  36.25 
 
 		 542 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  38.61 
 
 		 546 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  38.61 
 
 		 546 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  37.43 
 
 		 543 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  35.75 
 
 		 536 aa  263  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  38.34 
 
 		 546 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  36.25 
 
 		 541 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  38.74 
 
 		 546 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  36.19 
 
 		 525 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  36.13 
 
 		 531 aa  261  3e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  35.86 
 
 		 545 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  37.41 
 
 		 536 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  34.09 
 
 		 525 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  34.2 
 
 		 563 aa  256  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  36.62 
 
 		 552 aa  256  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  35.66 
 
 		 541 aa  256  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  38.93 
 
 		 546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  37.52 
 
 		 573 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  35.57 
 
 		 539 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  37.02 
 
 		 531 aa  253  4.0000000000000004e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  31.58 
 
 		 534 aa  252  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  34.64 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  36.06 
 
 		 565 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  33.83 
 
 		 545 aa  249  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  32.65 
 
 		 539 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  34.97 
 
 		 529 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  34.15 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  35.85 
 
 		 538 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  34.46 
 
 		 538 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  34.08 
 
 		 530 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  33.83 
 
 		 570 aa  247  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  35.71 
 
 		 531 aa  246  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>