More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4891 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  73.87 
 
 		 531 aa  716    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  73.68 
 
 		 531 aa  734    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  74.06 
 
 		 625 aa  717    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 532 aa  1054    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  75.94 
 
 		 532 aa  790    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  90.04 
 
 		 550 aa  939    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  59.2 
 
 		 536 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  53.93 
 
 		 522 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  54.13 
 
 		 543 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  53.75 
 
 		 533 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  51.05 
 
 		 531 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  49.14 
 
 		 532 aa  461  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  50.58 
 
 		 528 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  51.69 
 
 		 530 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  50.09 
 
 		 529 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  52.48 
 
 		 532 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  50.56 
 
 		 529 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  52.3 
 
 		 528 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  52.3 
 
 		 539 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  47.61 
 
 		 528 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  47.72 
 
 		 550 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  48.5 
 
 		 532 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  49.14 
 
 		 534 aa  428  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  50.1 
 
 		 527 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  45.18 
 
 		 525 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  43.74 
 
 		 531 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  43.92 
 
 		 523 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  43.53 
 
 		 539 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  43.53 
 
 		 539 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  41.15 
 
 		 522 aa  361  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  40.22 
 
 		 553 aa  319  7e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  41.44 
 
 		 552 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  38.29 
 
 		 540 aa  296  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  38.26 
 
 		 528 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  38.17 
 
 		 569 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  37.79 
 
 		 569 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  38.84 
 
 		 533 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  37.4 
 
 		 538 aa  277  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  37.14 
 
 		 513 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  39.63 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  39.63 
 
 		 557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  39.63 
 
 		 557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  38.07 
 
 		 524 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  39.27 
 
 		 557 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  39.27 
 
 		 557 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  39.27 
 
 		 634 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  39.27 
 
 		 557 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  39.27 
 
 		 557 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  35.81 
 
 		 541 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  37.8 
 
 		 533 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  37 
 
 		 545 aa  257  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  35.32 
 
 		 541 aa  257  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  39.66 
 
 		 543 aa  257  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  37.66 
 
 		 546 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  37.81 
 
 		 526 aa  253  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  36.38 
 
 		 545 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  35.81 
 
 		 542 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  35.99 
 
 		 542 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  37.94 
 
 		 546 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  38.42 
 
 		 546 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  38.42 
 
 		 546 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  39.34 
 
 		 539 aa  250  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  38.24 
 
 		 546 aa  250  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  38.24 
 
 		 546 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  34.85 
 
 		 512 aa  248  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  37.9 
 
 		 540 aa  247  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  38.42 
 
 		 546 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  37.86 
 
 		 568 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  36.21 
 
 		 545 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  36.91 
 
 		 549 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  35.26 
 
 		 537 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  35.39 
 
 		 539 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  34.08 
 
 		 563 aa  240  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  36.96 
 
 		 532 aa  240  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  36.25 
 
 		 552 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  35.89 
 
 		 539 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  36.72 
 
 		 531 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  35.23 
 
 		 529 aa  238  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  39.27 
 
 		 562 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  39.92 
 
 		 538 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  35.85 
 
 		 534 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  36.07 
 
 		 534 aa  233  9e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  36.28 
 
 		 536 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.85 
 
 		 538 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  35.06 
 
 		 543 aa  230  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  36.57 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  33.52 
 
 		 530 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  35.11 
 
 		 538 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.56 
 
 		 538 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  33.46 
 
 		 590 aa  226  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  34.96 
 
 		 558 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 		 570 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  33.08 
 
 		 537 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  33.03 
 
 		 545 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  34.81 
 
 		 542 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  30.87 
 
 		 539 aa  219  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  33.02 
 
 		 563 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  32.06 
 
 		 534 aa  219  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  35.69 
 
 		 593 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.51 
 
 		 527 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>