More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0445 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 532 aa  1101    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  61.28 
 
 		 543 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  60.23 
 
 		 522 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  63 
 
 		 532 aa  610  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  55.64 
 
 		 528 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  53.13 
 
 		 533 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  54.77 
 
 		 531 aa  552  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  54.22 
 
 		 529 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  54.49 
 
 		 529 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  52.94 
 
 		 532 aa  530  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  56.3 
 
 		 528 aa  522  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  52.47 
 
 		 530 aa  507  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  49.33 
 
 		 531 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  48.48 
 
 		 550 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  49.62 
 
 		 539 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  48.37 
 
 		 532 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  49.14 
 
 		 532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  49.24 
 
 		 527 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  47.52 
 
 		 536 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  48.64 
 
 		 528 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  48.73 
 
 		 531 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  49.02 
 
 		 625 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  46.04 
 
 		 534 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  48.63 
 
 		 531 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  49.42 
 
 		 525 aa  445  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  47.87 
 
 		 523 aa  438  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  46.45 
 
 		 550 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  47.31 
 
 		 522 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  42.99 
 
 		 539 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  42.99 
 
 		 539 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  41.75 
 
 		 528 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  41.27 
 
 		 569 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  42.99 
 
 		 552 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  40.88 
 
 		 538 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  40.69 
 
 		 569 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  39.62 
 
 		 540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  38.36 
 
 		 553 aa  357  3.9999999999999996e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  37.16 
 
 		 524 aa  330  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  35.04 
 
 		 513 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  36.73 
 
 		 545 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  35.99 
 
 		 545 aa  280  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  34.28 
 
 		 533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  35.34 
 
 		 534 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  34.77 
 
 		 541 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  36.14 
 
 		 545 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  35.01 
 
 		 533 aa  270  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  35.37 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  34.7 
 
 		 541 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 		 557 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 		 557 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 		 557 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 		 557 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  34.09 
 
 		 568 aa  266  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  35.96 
 
 		 538 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  33.96 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  35.4 
 
 		 543 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  35.42 
 
 		 536 aa  263  6.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  32.75 
 
 		 512 aa  262  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  33.78 
 
 		 526 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  34.02 
 
 		 527 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  34.81 
 
 		 634 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  32.47 
 
 		 568 aa  256  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  32.83 
 
 		 563 aa  256  9e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  33.52 
 
 		 525 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  33.14 
 
 		 529 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  34.07 
 
 		 538 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  33.97 
 
 		 539 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  30.38 
 
 		 589 aa  253  7e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  34.07 
 
 		 546 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  32.28 
 
 		 563 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  34.68 
 
 		 562 aa  252  9.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  32.59 
 
 		 570 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  32.77 
 
 		 537 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  33.77 
 
 		 534 aa  251  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  32.78 
 
 		 539 aa  251  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  34.14 
 
 		 538 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  34.07 
 
 		 546 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  32.4 
 
 		 534 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  35.06 
 
 		 534 aa  249  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  32.34 
 
 		 573 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  34.27 
 
 		 536 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  32.22 
 
 		 570 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  33.4 
 
 		 529 aa  248  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  31.67 
 
 		 570 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  32.02 
 
 		 558 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  32.33 
 
 		 531 aa  248  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  33.89 
 
 		 546 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  34.82 
 
 		 542 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  34.87 
 
 		 542 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  32.48 
 
 		 542 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  33.89 
 
 		 546 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  33.89 
 
 		 546 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  33.89 
 
 		 546 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  33.52 
 
 		 539 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  32.04 
 
 		 570 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  32.41 
 
 		 570 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  31.85 
 
 		 545 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  31.85 
 
 		 570 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>