More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1832 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  76.5 
 
 		 532 aa  809    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  90.04 
 
 		 532 aa  924    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  73.68 
 
 		 531 aa  751    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  74.25 
 
 		 531 aa  736    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  73.36 
 
 		 625 aa  740    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 		 550 aa  1098    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  58.43 
 
 		 536 aa  558  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  53.51 
 
 		 543 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  54.68 
 
 		 533 aa  488  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  53.55 
 
 		 522 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  48.48 
 
 		 532 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  51.13 
 
 		 530 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  50 
 
 		 528 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  51.15 
 
 		 531 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  51.78 
 
 		 532 aa  458  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  49.16 
 
 		 529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  50.96 
 
 		 528 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  51.93 
 
 		 539 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  48.5 
 
 		 532 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  48.86 
 
 		 534 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  47.94 
 
 		 529 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  48.08 
 
 		 550 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  47.01 
 
 		 528 aa  432  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  48.48 
 
 		 527 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  45.75 
 
 		 525 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  44.44 
 
 		 523 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  44.51 
 
 		 531 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  41.6 
 
 		 522 aa  364  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  42.72 
 
 		 539 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  42.72 
 
 		 539 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  41.45 
 
 		 553 aa  336  7e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  40.37 
 
 		 552 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  38.58 
 
 		 540 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  37.76 
 
 		 528 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  38.07 
 
 		 569 aa  292  8e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  37.6 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  37.21 
 
 		 538 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  38.65 
 
 		 533 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  36.49 
 
 		 513 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  38.72 
 
 		 557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  38.19 
 
 		 526 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  38.72 
 
 		 557 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  38.72 
 
 		 557 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  37.25 
 
 		 545 aa  269  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  35.97 
 
 		 524 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  38.53 
 
 		 557 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  38.53 
 
 		 557 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  38.53 
 
 		 557 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  38.53 
 
 		 557 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  37.36 
 
 		 545 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  37.91 
 
 		 634 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  39.2 
 
 		 539 aa  263  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  35.62 
 
 		 541 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  35.44 
 
 		 541 aa  259  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  37.52 
 
 		 533 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  37.43 
 
 		 568 aa  258  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  37.94 
 
 		 546 aa  256  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  38.66 
 
 		 546 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  37.29 
 
 		 546 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  37.13 
 
 		 545 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  38.48 
 
 		 546 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  38.48 
 
 		 546 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  38.84 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  35.62 
 
 		 542 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  38.29 
 
 		 546 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  35.62 
 
 		 542 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  37.13 
 
 		 540 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  34.77 
 
 		 512 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  34.31 
 
 		 529 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  35.75 
 
 		 537 aa  243  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  36.35 
 
 		 531 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  38.42 
 
 		 538 aa  242  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  36.07 
 
 		 539 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  33.09 
 
 		 563 aa  240  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  34.9 
 
 		 539 aa  239  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  36.95 
 
 		 543 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  36.91 
 
 		 549 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  38.13 
 
 		 562 aa  237  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  35.32 
 
 		 558 aa  237  5.0000000000000005e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  35.13 
 
 		 543 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  35.6 
 
 		 552 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  38.16 
 
 		 531 aa  232  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  35.22 
 
 		 534 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  35.71 
 
 		 532 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  36.84 
 
 		 529 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  35.23 
 
 		 542 aa  227  4e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  35.87 
 
 		 536 aa  226  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  35.14 
 
 		 534 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  32.78 
 
 		 590 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  33.88 
 
 		 563 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  35.33 
 
 		 538 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  34.95 
 
 		 538 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  31.1 
 
 		 539 aa  221  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 		 530 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  34.27 
 
 		 573 aa  220  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  33.84 
 
 		 538 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  32 
 
 		 537 aa  218  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  32.91 
 
 		 570 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  33.09 
 
 		 545 aa  216  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  34.88 
 
 		 536 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>