More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3315 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  77.78 
 
 		 529 aa  805    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  74.58 
 
 		 528 aa  743    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  81.17 
 
 		 529 aa  850    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  93.41 
 
 		 528 aa  986    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 531 aa  1082    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  56.65 
 
 		 543 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  54.77 
 
 		 532 aa  552  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  57.14 
 
 		 522 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  56.9 
 
 		 532 aa  518  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  52.04 
 
 		 532 aa  502  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  51.96 
 
 		 530 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  52.61 
 
 		 533 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  50.67 
 
 		 550 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  50.75 
 
 		 527 aa  475  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  48.59 
 
 		 531 aa  478  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  50.1 
 
 		 550 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  50.86 
 
 		 532 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  51.05 
 
 		 536 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  51.18 
 
 		 531 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  50.98 
 
 		 625 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  49.81 
 
 		 525 aa  467  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  50.46 
 
 		 539 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  48.19 
 
 		 528 aa  465  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  49.32 
 
 		 531 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  48.48 
 
 		 532 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  49.03 
 
 		 523 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  48.51 
 
 		 534 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  47.2 
 
 		 522 aa  425  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  43.42 
 
 		 539 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  43.42 
 
 		 539 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  40.95 
 
 		 553 aa  378  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  42.1 
 
 		 569 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  42.1 
 
 		 538 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  41.9 
 
 		 569 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  41.57 
 
 		 528 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  41 
 
 		 540 aa  336  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  41.5 
 
 		 552 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  39.85 
 
 		 524 aa  326  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  38.31 
 
 		 513 aa  316  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  34.93 
 
 		 533 aa  254  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  36.22 
 
 		 533 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  35.77 
 
 		 531 aa  253  8.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  34.1 
 
 		 512 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  33.77 
 
 		 545 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  35.9 
 
 		 543 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  35.5 
 
 		 557 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  36.25 
 
 		 546 aa  248  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  35.33 
 
 		 546 aa  248  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  35.5 
 
 		 557 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  35.32 
 
 		 557 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  35.97 
 
 		 538 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  35.97 
 
 		 538 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  35.32 
 
 		 557 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  33.4 
 
 		 545 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  35.32 
 
 		 557 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  35.32 
 
 		 557 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  35.32 
 
 		 557 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  34.72 
 
 		 549 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  35.69 
 
 		 546 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  35.69 
 
 		 546 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  33.4 
 
 		 526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  34.57 
 
 		 634 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  33.75 
 
 		 593 aa  239  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  35.69 
 
 		 546 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  31.61 
 
 		 563 aa  239  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  33.4 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  32.71 
 
 		 541 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  33.58 
 
 		 542 aa  238  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  35.38 
 
 		 546 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  33.65 
 
 		 534 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  35.95 
 
 		 562 aa  233  8.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  32.9 
 
 		 541 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  31.87 
 
 		 530 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  34.39 
 
 		 538 aa  231  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  34.87 
 
 		 539 aa  231  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 		 539 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  33.83 
 
 		 536 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 		 542 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 		 542 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  33.46 
 
 		 534 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  36.02 
 
 		 531 aa  228  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  33.46 
 
 		 540 aa  227  4e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  34.87 
 
 		 538 aa  227  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  33.97 
 
 		 568 aa  226  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  35.38 
 
 		 546 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  33.27 
 
 		 537 aa  226  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  32.07 
 
 		 522 aa  224  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  33.58 
 
 		 525 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  32.9 
 
 		 545 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  33.4 
 
 		 552 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  34.38 
 
 		 531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  32.95 
 
 		 529 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  32.51 
 
 		 531 aa  221  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  32.65 
 
 		 573 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  32.71 
 
 		 535 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  30.38 
 
 		 534 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  32.72 
 
 		 590 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  32.86 
 
 		 558 aa  217  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  31.04 
 
 		 545 aa  217  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3055  gamma-glutamyltransferase  34.71 
 
 		 541 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>