More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0492 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 
522 aa  1071    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  59.34 
 
 
523 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  52.7 
 
 
525 aa  520  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  51.84 
 
 
528 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  50.96 
 
 
550 aa  485  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  47.63 
 
 
533 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  47.56 
 
 
529 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  49.61 
 
 
528 aa  425  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  47.47 
 
 
529 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  47.49 
 
 
530 aa  428  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  47.28 
 
 
528 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  47.31 
 
 
532 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  47.2 
 
 
531 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  44.08 
 
 
531 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  46.33 
 
 
527 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  43.69 
 
 
536 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  45.37 
 
 
532 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  45.66 
 
 
543 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  44.79 
 
 
522 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  47.32 
 
 
532 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  44.89 
 
 
539 aa  382  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  41.49 
 
 
532 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  42.94 
 
 
531 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  41.6 
 
 
550 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  42.75 
 
 
531 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  42.94 
 
 
625 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  41.15 
 
 
532 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  40.72 
 
 
539 aa  342  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  40.72 
 
 
539 aa  342  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  39.27 
 
 
534 aa  339  9e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  37.69 
 
 
569 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  37.12 
 
 
528 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  36.15 
 
 
569 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  36.78 
 
 
538 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  35.76 
 
 
540 aa  289  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  34.48 
 
 
524 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  36.25 
 
 
552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  35.16 
 
 
553 aa  274  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  33.91 
 
 
513 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  31.46 
 
 
525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  32.04 
 
 
533 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  32.88 
 
 
534 aa  213  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  32.95 
 
 
534 aa  210  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  32.53 
 
 
546 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  32.53 
 
 
546 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  32.78 
 
 
546 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  32.53 
 
 
546 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  31.97 
 
 
546 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  31.59 
 
 
546 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  31.59 
 
 
531 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  30.64 
 
 
538 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  31.9 
 
 
532 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  31.54 
 
 
527 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  31.93 
 
 
579 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  31.49 
 
 
533 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  30.21 
 
 
539 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  29.06 
 
 
530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  32.02 
 
 
545 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  32.78 
 
 
546 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  32.26 
 
 
536 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  30.04 
 
 
541 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  31.55 
 
 
541 aa  196  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  30.21 
 
 
542 aa  196  9e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0878  gamma-glutamyltransferase  32.49 
 
 
503 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  31.89 
 
 
542 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  30.93 
 
 
563 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  31.09 
 
 
545 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  29.39 
 
 
558 aa  193  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  29.63 
 
 
568 aa  193  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  31.89 
 
 
542 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  29.9 
 
 
529 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  31.26 
 
 
564 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  30.39 
 
 
570 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  31.07 
 
 
539 aa  191  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  31.23 
 
 
634 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  30.21 
 
 
570 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  30.45 
 
 
570 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  29.92 
 
 
570 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  31.23 
 
 
568 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  30.39 
 
 
570 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  29.81 
 
 
545 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0872  gamma-glutamyltransferase  32.1 
 
 
530 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  31.61 
 
 
543 aa  189  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  29.92 
 
 
570 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  29.92 
 
 
570 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0889  gamma-glutamyltransferase  32.1 
 
 
530 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  32.57 
 
 
531 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  30.17 
 
 
538 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  30.12 
 
 
512 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  31.07 
 
 
549 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2197  putative gamma-glutamyltranspeptidase  29.46 
 
 
511 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  30.81 
 
 
557 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  30.81 
 
 
557 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  29.81 
 
 
563 aa  186  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2624  gamma-glutamyltransferase 2  29.8 
 
 
508 aa  186  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  28.6 
 
 
541 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  30.81 
 
 
557 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  29.94 
 
 
525 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  30.15 
 
 
552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4906  gamma-glutamyltransferase  29.96 
 
 
528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>