More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1050 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  100 
 
 
522 aa  1059    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  85.82 
 
 
543 aa  896    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  65.01 
 
 
532 aa  623  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  60.23 
 
 
532 aa  620  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  57.55 
 
 
529 aa  558  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  56.7 
 
 
528 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  57.14 
 
 
531 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  58.37 
 
 
528 aa  544  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  56.41 
 
 
529 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  55.28 
 
 
533 aa  536  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  54.68 
 
 
530 aa  524  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  52 
 
 
532 aa  508  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  53.55 
 
 
550 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  53.04 
 
 
532 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  52.77 
 
 
536 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  53.93 
 
 
532 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  53.24 
 
 
527 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  52.56 
 
 
531 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  53.54 
 
 
625 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  53.35 
 
 
531 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  49.72 
 
 
534 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  46.76 
 
 
531 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  50.94 
 
 
539 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  47.48 
 
 
523 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  45.26 
 
 
528 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  44.89 
 
 
539 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  44.89 
 
 
539 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  45.45 
 
 
525 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  44.7 
 
 
550 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  44.79 
 
 
522 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  41.25 
 
 
553 aa  357  3.9999999999999996e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  41 
 
 
569 aa  352  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  41.19 
 
 
569 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  40.12 
 
 
528 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  40.8 
 
 
538 aa  350  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  42.86 
 
 
552 aa  340  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  38.39 
 
 
540 aa  318  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  36.47 
 
 
524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  40.23 
 
 
562 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  35.48 
 
 
513 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  36.63 
 
 
512 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  37.48 
 
 
568 aa  269  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  36.28 
 
 
545 aa  267  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  37.45 
 
 
539 aa  266  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  36.16 
 
 
533 aa  264  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  38.09 
 
 
634 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  38.27 
 
 
557 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  38.27 
 
 
557 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  37.05 
 
 
549 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  38.09 
 
 
557 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  38.09 
 
 
557 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  38.09 
 
 
557 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  38.09 
 
 
557 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  38.09 
 
 
557 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  36.15 
 
 
533 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  35.36 
 
 
522 aa  260  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  35.71 
 
 
545 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  38.55 
 
 
538 aa  259  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  36.75 
 
 
543 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  36.28 
 
 
545 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  37.19 
 
 
536 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  36.1 
 
 
526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  37.03 
 
 
546 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  35.31 
 
 
539 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  34.64 
 
 
525 aa  250  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  36.11 
 
 
552 aa  250  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  35.66 
 
 
542 aa  249  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  35.66 
 
 
542 aa  249  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  36.47 
 
 
546 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  33.4 
 
 
541 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  33.9 
 
 
563 aa  246  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  33.77 
 
 
541 aa  246  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  36.47 
 
 
546 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  36.47 
 
 
546 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  36.28 
 
 
546 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  34.72 
 
 
539 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  34.35 
 
 
525 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  33.46 
 
 
534 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  36.28 
 
 
546 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  38.7 
 
 
532 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  31.5 
 
 
534 aa  239  8e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  35.46 
 
 
542 aa  239  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  33.21 
 
 
534 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  34.79 
 
 
537 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  34.16 
 
 
536 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  32.46 
 
 
545 aa  238  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  33.64 
 
 
563 aa  238  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 
558 aa  237  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  35.48 
 
 
531 aa  237  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  33.77 
 
 
570 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  32.9 
 
 
570 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  32.44 
 
 
530 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  33.77 
 
 
570 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  36.14 
 
 
540 aa  236  9e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  36.09 
 
 
546 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  32.82 
 
 
529 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  33.58 
 
 
570 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  32.14 
 
 
537 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  34.77 
 
 
573 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  35.05 
 
 
525 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>