More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3832 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  67.88 
 
 		 513 aa  682    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 524 aa  1059    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  43.59 
 
 		 569 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  44.29 
 
 		 540 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  43.8 
 
 		 528 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  41.87 
 
 		 569 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  42.26 
 
 		 538 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  40.26 
 
 		 533 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  39.46 
 
 		 529 aa  316  6e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  37.16 
 
 		 532 aa  313  5.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  39.89 
 
 		 529 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  38.27 
 
 		 532 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  39.85 
 
 		 531 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  39.11 
 
 		 539 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  38.61 
 
 		 552 aa  301  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  38 
 
 		 528 aa  300  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  37.12 
 
 		 525 aa  299  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  37.88 
 
 		 543 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  38.17 
 
 		 536 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  35.04 
 
 		 528 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  38.74 
 
 		 530 aa  293  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  38.01 
 
 		 532 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  35.5 
 
 		 531 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  36.17 
 
 		 523 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  37.03 
 
 		 532 aa  285  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  39.58 
 
 		 527 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  36.47 
 
 		 522 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  38.33 
 
 		 528 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  34.91 
 
 		 539 aa  280  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  34.91 
 
 		 539 aa  280  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  34.18 
 
 		 553 aa  276  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  34.79 
 
 		 550 aa  274  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  37.55 
 
 		 531 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  38.13 
 
 		 625 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  38.13 
 
 		 531 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  34.48 
 
 		 522 aa  266  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  35.92 
 
 		 550 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  36.35 
 
 		 534 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  38.07 
 
 		 532 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  36.04 
 
 		 543 aa  236  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 		 541 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  36.45 
 
 		 542 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  36.93 
 
 		 542 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  32.6 
 
 		 531 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  35.83 
 
 		 527 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  31.07 
 
 		 529 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  28.92 
 
 		 589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  32.89 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  33.71 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  31.09 
 
 		 542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  33.09 
 
 		 540 aa  196  9e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  33.14 
 
 		 533 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  32.32 
 
 		 533 aa  194  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  30.06 
 
 		 561 aa  193  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  30.82 
 
 		 558 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  31.94 
 
 		 545 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  32.48 
 
 		 545 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  32.87 
 
 		 542 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4079  gamma-glutamyltransferase  32.09 
 
 		 528 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  32.67 
 
 		 542 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  30.82 
 
 		 568 aa  191  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  32.83 
 
 		 533 aa  190  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  31.4 
 
 		 529 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  30.43 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  33.52 
 
 		 562 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  33.01 
 
 		 593 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  30.15 
 
 		 545 aa  186  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  32.25 
 
 		 573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  29.74 
 
 		 563 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  29.5 
 
 		 570 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  30.8 
 
 		 564 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  29.28 
 
 		 570 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  31.8 
 
 		 536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  29.28 
 
 		 570 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  29.93 
 
 		 570 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  31.25 
 
 		 538 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  31.21 
 
 		 565 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  29.93 
 
 		 570 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  31.46 
 
 		 545 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  29.93 
 
 		 570 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  29.07 
 
 		 570 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  29.28 
 
 		 570 aa  181  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  29.05 
 
 		 579 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  32.53 
 
 		 541 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1352  gamma-glutamyltransferase  31.89 
 
 		 528 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  28.26 
 
 		 563 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  28.17 
 
 		 528 aa  180  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  31.45 
 
 		 525 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  30.87 
 
 		 527 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4227  gamma-glutamyltransferase  31.76 
 
 		 528 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  33.4 
 
 		 538 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  32.28 
 
 		 534 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 		 525 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4906  gamma-glutamyltransferase  31.66 
 
 		 528 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  32.47 
 
 		 557 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  32.47 
 
 		 557 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  32.47 
 
 		 557 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5039  Gamma-glutamyltransferase  33.78 
 
 		 524 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0709961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  33.33 
 
 		 538 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  32.23 
 
 		 546 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>