More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1433 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 527 aa  1048    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  64.78 
 
 		 530 aa  633  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  54.25 
 
 		 536 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  53.25 
 
 		 543 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  53.28 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  55.35 
 
 		 539 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  53.56 
 
 		 533 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  51.69 
 
 		 529 aa  478  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  53.24 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  51.96 
 
 		 532 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  50.75 
 
 		 531 aa  474  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  49.24 
 
 		 532 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  48.48 
 
 		 531 aa  462  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  49.91 
 
 		 528 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  51.7 
 
 		 528 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  50.29 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  47.28 
 
 		 528 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  50.75 
 
 		 532 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  47.12 
 
 		 550 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  46.59 
 
 		 523 aa  438  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  48.48 
 
 		 550 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  50.29 
 
 		 531 aa  432  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  50.1 
 
 		 532 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  50.29 
 
 		 531 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  50.49 
 
 		 625 aa  425  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  45.72 
 
 		 525 aa  415  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  46.33 
 
 		 522 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  46.93 
 
 		 534 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  44.32 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  44.32 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  42.61 
 
 		 540 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  42.1 
 
 		 553 aa  348  2e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  41.18 
 
 		 569 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  40.23 
 
 		 538 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  40.23 
 
 		 569 aa  323  7e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  43.53 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  39.92 
 
 		 528 aa  312  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  39.54 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  39.58 
 
 		 524 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  38.73 
 
 		 543 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  37.66 
 
 		 531 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  35.19 
 
 		 570 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  36.03 
 
 		 512 aa  248  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  38.37 
 
 		 538 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  34.32 
 
 		 563 aa  244  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  35.55 
 
 		 533 aa  243  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  34.63 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  34.63 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  34.57 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  34.69 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  34.63 
 
 		 570 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  36.08 
 
 		 526 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  34.69 
 
 		 570 aa  240  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  34.69 
 
 		 570 aa  240  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  34.76 
 
 		 568 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  34.62 
 
 		 545 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  34.56 
 
 		 563 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  34.53 
 
 		 522 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  36.15 
 
 		 568 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  33.58 
 
 		 564 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  35.87 
 
 		 573 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  37.73 
 
 		 540 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  34.71 
 
 		 536 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  34.67 
 
 		 537 aa  233  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  34.66 
 
 		 558 aa  233  9e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4079  gamma-glutamyltransferase  34.02 
 
 		 528 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  35.88 
 
 		 542 aa  232  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  31.82 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  35 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  33.71 
 
 		 534 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  33.89 
 
 		 541 aa  231  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  38.11 
 
 		 562 aa  230  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  37.27 
 
 		 557 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  35.8 
 
 		 539 aa  230  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4906  gamma-glutamyltransferase  34.59 
 
 		 528 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  37.27 
 
 		 557 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  37.27 
 
 		 557 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  34.03 
 
 		 549 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  34.26 
 
 		 535 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  36.59 
 
 		 542 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  37.04 
 
 		 531 aa  229  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  34.86 
 
 		 525 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2197  putative gamma-glutamyltranspeptidase  34.35 
 
 		 511 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  34.15 
 
 		 525 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  36.9 
 
 		 557 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  36.9 
 
 		 557 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  36.13 
 
 		 542 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  36.9 
 
 		 557 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  36.9 
 
 		 557 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  35.53 
 
 		 538 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  35.12 
 
 		 590 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  31.64 
 
 		 534 aa  223  6e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  36.85 
 
 		 634 aa  223  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  37.08 
 
 		 546 aa  223  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  33.15 
 
 		 534 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1352  gamma-glutamyltransferase  34.08 
 
 		 528 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  34.67 
 
 		 533 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  32.85 
 
 		 565 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  37.2 
 
 		 546 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  37.2 
 
 		 546 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>