More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2100 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 540 aa  1089    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  57.92 
 
 		 569 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  57.34 
 
 		 569 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  56.76 
 
 		 538 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  57.17 
 
 		 528 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  44.29 
 
 		 524 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  44.29 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  42.53 
 
 		 533 aa  358  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  40.95 
 
 		 539 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  40.95 
 
 		 539 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  39.62 
 
 		 532 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  42.61 
 
 		 527 aa  349  8e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  42.5 
 
 		 530 aa  349  9e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  39.82 
 
 		 552 aa  346  5e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  42.34 
 
 		 529 aa  341  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  40 
 
 		 532 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  40.11 
 
 		 532 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  41.84 
 
 		 529 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  41.04 
 
 		 528 aa  334  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  38.24 
 
 		 553 aa  334  3e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  41 
 
 		 531 aa  332  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  40.23 
 
 		 536 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  38.89 
 
 		 543 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  39.7 
 
 		 539 aa  322  8e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  40.04 
 
 		 532 aa  319  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  39.45 
 
 		 531 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  42 
 
 		 528 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  36.9 
 
 		 523 aa  313  5.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  37.91 
 
 		 528 aa  312  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  38.08 
 
 		 525 aa  312  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  39.45 
 
 		 625 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  38.39 
 
 		 522 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  39.45 
 
 		 531 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  38.58 
 
 		 550 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  37.52 
 
 		 550 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  38.1 
 
 		 532 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  38.97 
 
 		 534 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  35.76 
 
 		 522 aa  291  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  38.33 
 
 		 543 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  34.82 
 
 		 531 aa  283  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  35.77 
 
 		 512 aa  266  8.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  36.52 
 
 		 573 aa  263  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  34.76 
 
 		 564 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  36.42 
 
 		 541 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  35.63 
 
 		 541 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  35.28 
 
 		 579 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  37.04 
 
 		 526 aa  254  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  34.24 
 
 		 593 aa  252  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  35.35 
 
 		 533 aa  249  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  35.74 
 
 		 541 aa  249  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  34.87 
 
 		 570 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  34.67 
 
 		 570 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  36.66 
 
 		 568 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  33.64 
 
 		 570 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  33.64 
 
 		 545 aa  244  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  35.24 
 
 		 565 aa  243  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  32.15 
 
 		 563 aa  243  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  35.89 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  34.35 
 
 		 525 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  35.89 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  34.47 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  35.89 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  35.89 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  35.89 
 
 		 557 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  35.89 
 
 		 557 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  33.64 
 
 		 570 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  35.89 
 
 		 557 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  37.31 
 
 		 542 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  35.43 
 
 		 570 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  34 
 
 		 545 aa  240  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4079  gamma-glutamyltransferase  33.71 
 
 		 528 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  33.64 
 
 		 570 aa  239  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  34 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  33.46 
 
 		 570 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  34.54 
 
 		 534 aa  237  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  30.83 
 
 		 589 aa  237  5.0000000000000005e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4227  gamma-glutamyltransferase  33.83 
 
 		 528 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  35.14 
 
 		 634 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  35.67 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4906  gamma-glutamyltransferase  33.9 
 
 		 528 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  36.11 
 
 		 538 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  32.64 
 
 		 525 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  37.31 
 
 		 542 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  34.33 
 
 		 529 aa  233  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  34.65 
 
 		 539 aa  233  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  35.35 
 
 		 542 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  35.15 
 
 		 542 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  33.08 
 
 		 545 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  30.93 
 
 		 529 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 		 563 aa  230  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  35.02 
 
 		 536 aa  230  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  36.62 
 
 		 552 aa  230  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  33.77 
 
 		 529 aa  230  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  33.46 
 
 		 534 aa  229  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  36.26 
 
 		 562 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  35.46 
 
 		 546 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  35.54 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2197  putative gamma-glutamyltranspeptidase  32.12 
 
 		 511 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  32.83 
 
 		 533 aa  227  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1352  gamma-glutamyltransferase  34.39 
 
 		 528 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>