More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3318 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 534 aa  1050    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  51.58 
 
 		 533 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  49.72 
 
 		 543 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  49.72 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  48.04 
 
 		 532 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  51.55 
 
 		 539 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  48.86 
 
 		 550 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  50.29 
 
 		 536 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  50.84 
 
 		 532 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  49.44 
 
 		 529 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  46.04 
 
 		 532 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  48.51 
 
 		 531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  48.97 
 
 		 528 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  49.14 
 
 		 532 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  50.65 
 
 		 528 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  48.41 
 
 		 530 aa  433  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  47.57 
 
 		 529 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  46.39 
 
 		 532 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  46.78 
 
 		 531 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  47.17 
 
 		 625 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  46.93 
 
 		 527 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  46.98 
 
 		 531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  43.28 
 
 		 531 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  41.75 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  43.13 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  44.07 
 
 		 539 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  44.07 
 
 		 539 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  41.11 
 
 		 550 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  41.44 
 
 		 523 aa  347  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  39.27 
 
 		 522 aa  347  4e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  39.02 
 
 		 553 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  41.82 
 
 		 552 aa  320  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  40.53 
 
 		 569 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  41.06 
 
 		 569 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  40.99 
 
 		 528 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  40.72 
 
 		 538 aa  317  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  39.16 
 
 		 540 aa  295  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  37.18 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  36.72 
 
 		 524 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  38.68 
 
 		 568 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  36.14 
 
 		 533 aa  255  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  36.31 
 
 		 533 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  34.82 
 
 		 536 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  36.28 
 
 		 549 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  35 
 
 		 538 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  33.83 
 
 		 534 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  38.14 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  38.88 
 
 		 539 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  34.91 
 
 		 526 aa  238  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  33.9 
 
 		 529 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  35.82 
 
 		 525 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  35.79 
 
 		 529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  35.74 
 
 		 543 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  37.1 
 
 		 562 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  33.27 
 
 		 545 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  30.26 
 
 		 534 aa  233  7.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  34.14 
 
 		 525 aa  233  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  33.39 
 
 		 541 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  33.09 
 
 		 545 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  34.44 
 
 		 557 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  30.71 
 
 		 528 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  34.44 
 
 		 557 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  34.44 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  37.08 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  33.4 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  34.33 
 
 		 536 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  34.06 
 
 		 634 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  32.9 
 
 		 541 aa  228  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.69 
 
 		 538 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  34.25 
 
 		 557 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  34.25 
 
 		 557 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  34.25 
 
 		 557 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  34.25 
 
 		 557 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.13 
 
 		 538 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  31.53 
 
 		 537 aa  224  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 		 522 aa  224  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0149  gamma-glutamyltransferase  36.4 
 
 		 542 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  30.65 
 
 		 589 aa  223  7e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  32.98 
 
 		 593 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  33.52 
 
 		 534 aa  222  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  32.95 
 
 		 512 aa  220  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  36.28 
 
 		 542 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  33.09 
 
 		 545 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  33.46 
 
 		 534 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  35.33 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  34.46 
 
 		 527 aa  217  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  32.59 
 
 		 535 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  31.07 
 
 		 541 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6881  Gamma-glutamyltransferase  35.54 
 
 		 512 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0680633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  32.18 
 
 		 563 aa  210  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  33.52 
 
 		 542 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  32.58 
 
 		 531 aa  210  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  33.7 
 
 		 546 aa  210  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  34.26 
 
 		 539 aa  210  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  35 
 
 		 531 aa  210  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  33.79 
 
 		 546 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  33.82 
 
 		 546 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  34.38 
 
 		 531 aa  208  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  33.82 
 
 		 546 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  30 
 
 		 561 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>