More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5336 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  69.73 
 
 		 528 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 538 aa  1091    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  96.28 
 
 		 569 aa  1030    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  89.22 
 
 		 569 aa  962    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  56.76 
 
 		 540 aa  561  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  43.64 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  43.64 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  42.26 
 
 		 524 aa  399  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  43.87 
 
 		 513 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  40.88 
 
 		 532 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  43.24 
 
 		 533 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  40.49 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  42.1 
 
 		 531 aa  369  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  44.25 
 
 		 528 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  41.57 
 
 		 528 aa  364  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  42.37 
 
 		 529 aa  362  8e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  41.87 
 
 		 529 aa  359  6e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  42.48 
 
 		 530 aa  352  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  38.67 
 
 		 553 aa  347  5e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  40.04 
 
 		 532 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  40.84 
 
 		 543 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  40.8 
 
 		 522 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  40.49 
 
 		 536 aa  333  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  39.4 
 
 		 531 aa  333  4e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  37.43 
 
 		 523 aa  331  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  38.68 
 
 		 528 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  37.88 
 
 		 550 aa  326  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  40.23 
 
 		 527 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  40.42 
 
 		 532 aa  319  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  38.88 
 
 		 525 aa  318  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  39.77 
 
 		 534 aa  316  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.78 
 
 		 522 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  40.71 
 
 		 539 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  39.58 
 
 		 532 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  40.47 
 
 		 625 aa  310  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  40.47 
 
 		 531 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  39.57 
 
 		 531 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  37.21 
 
 		 550 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  37.21 
 
 		 532 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  37.15 
 
 		 542 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  36.77 
 
 		 542 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  37.26 
 
 		 543 aa  277  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  36.8 
 
 		 593 aa  273  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  37.12 
 
 		 526 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  36.17 
 
 		 573 aa  270  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  35.65 
 
 		 541 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  36.61 
 
 		 579 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  36.77 
 
 		 536 aa  266  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  33.9 
 
 		 563 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  35.01 
 
 		 512 aa  265  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  34.33 
 
 		 541 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  38.5 
 
 		 542 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  36.84 
 
 		 552 aa  259  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  34.34 
 
 		 541 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  34.27 
 
 		 525 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  34.91 
 
 		 527 aa  253  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  35.28 
 
 		 533 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  32.34 
 
 		 529 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  34.44 
 
 		 545 aa  248  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  33.81 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  31.24 
 
 		 589 aa  246  4.9999999999999997e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  34.26 
 
 		 545 aa  246  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  33.52 
 
 		 565 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  33.81 
 
 		 570 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  33.45 
 
 		 545 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  36.23 
 
 		 538 aa  244  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.14 
 
 		 538 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.52 
 
 		 538 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  33.45 
 
 		 570 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  32.77 
 
 		 564 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  33.45 
 
 		 570 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  33.96 
 
 		 529 aa  243  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  34.84 
 
 		 539 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  35.11 
 
 		 570 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  33.27 
 
 		 534 aa  243  9e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  36.26 
 
 		 542 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  35.11 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  33.03 
 
 		 535 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  35.11 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  34.72 
 
 		 570 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  34.87 
 
 		 533 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  34.41 
 
 		 539 aa  242  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  34.2 
 
 		 545 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 		 529 aa  240  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  33.65 
 
 		 534 aa  239  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  34.1 
 
 		 568 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  33.57 
 
 		 568 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  31.85 
 
 		 586 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  30.33 
 
 		 599 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  31.96 
 
 		 528 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  30.78 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  33.89 
 
 		 557 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  33.89 
 
 		 557 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  33.57 
 
 		 563 aa  237  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  31.14 
 
 		 589 aa  237  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  31.75 
 
 		 561 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  33.7 
 
 		 557 aa  236  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  32.33 
 
 		 534 aa  236  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  30.2 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  33.96 
 
 		 525 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>