More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3471 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  78.07 
 
 		 529 aa  810    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  93.41 
 
 		 531 aa  986    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 528 aa  1075    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  75.95 
 
 		 528 aa  757    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  80.34 
 
 		 529 aa  843    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  55.64 
 
 		 532 aa  565  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  56.79 
 
 		 543 aa  568  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  56.7 
 
 		 522 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  56.47 
 
 		 532 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  51.22 
 
 		 533 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  51.59 
 
 		 530 aa  490  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  50.84 
 
 		 532 aa  489  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  50 
 
 		 550 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  49.05 
 
 		 531 aa  478  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  50.58 
 
 		 532 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  51.28 
 
 		 531 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  51.08 
 
 		 625 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  49.91 
 
 		 527 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  49.41 
 
 		 531 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  48.55 
 
 		 550 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  49.81 
 
 		 536 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  48 
 
 		 532 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  49.63 
 
 		 539 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  49.51 
 
 		 525 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  47.32 
 
 		 528 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  48.97 
 
 		 534 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  47.95 
 
 		 523 aa  445  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  47.28 
 
 		 522 aa  428  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  43.67 
 
 		 539 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  43.67 
 
 		 539 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  41.22 
 
 		 553 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  41.76 
 
 		 569 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  41.76 
 
 		 569 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  41.57 
 
 		 538 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  40.46 
 
 		 528 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  41.04 
 
 		 540 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  41.54 
 
 		 552 aa  333  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  38 
 
 		 524 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  37.09 
 
 		 513 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  36.43 
 
 		 533 aa  259  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  34.76 
 
 		 533 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  36.52 
 
 		 531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  36.26 
 
 		 546 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  37.81 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.93 
 
 		 538 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  35.58 
 
 		 546 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  33.33 
 
 		 545 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  35.73 
 
 		 543 aa  249  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  32.53 
 
 		 563 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  34.96 
 
 		 557 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  34.96 
 
 		 557 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  34.96 
 
 		 557 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  34.96 
 
 		 557 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  34.77 
 
 		 557 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  34.77 
 
 		 557 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  34.77 
 
 		 557 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  36.19 
 
 		 549 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 		 545 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  35.51 
 
 		 546 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  33.98 
 
 		 512 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  35.51 
 
 		 546 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  32.7 
 
 		 541 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  35.51 
 
 		 546 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  33.59 
 
 		 529 aa  240  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  34.18 
 
 		 593 aa  240  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  33.72 
 
 		 526 aa  240  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  35.21 
 
 		 546 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  33.08 
 
 		 541 aa  239  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  34.27 
 
 		 537 aa  239  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  35.08 
 
 		 539 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  36.17 
 
 		 562 aa  237  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  33.65 
 
 		 634 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  34.03 
 
 		 534 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  33.9 
 
 		 534 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  31.73 
 
 		 530 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  35.21 
 
 		 546 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 		 539 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 		 542 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  34.1 
 
 		 568 aa  230  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  35.24 
 
 		 531 aa  229  8e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  33.58 
 
 		 542 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 		 536 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  33.58 
 
 		 542 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  33.83 
 
 		 540 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  35.08 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  33.08 
 
 		 535 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  34.21 
 
 		 538 aa  226  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  36.03 
 
 		 531 aa  226  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  34.16 
 
 		 552 aa  225  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  33.58 
 
 		 573 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  32.08 
 
 		 545 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3055  gamma-glutamyltransferase  35.04 
 
 		 541 aa  223  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  32.04 
 
 		 565 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  32.89 
 
 		 531 aa  223  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  33.4 
 
 		 537 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  32.71 
 
 		 522 aa  221  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 		 525 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  31.38 
 
 		 534 aa  221  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  31.03 
 
 		 545 aa  220  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  31.03 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>