More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4543 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
543 aa  1101    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  85.82 
 
 
522 aa  873    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  61.51 
 
 
532 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  63.76 
 
 
532 aa  620  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  56.79 
 
 
528 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  57.63 
 
 
529 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  57.87 
 
 
529 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  56.65 
 
 
531 aa  555  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  55.89 
 
 
533 aa  548  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  57.38 
 
 
528 aa  538  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  54.32 
 
 
530 aa  529  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  54.37 
 
 
532 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  52.06 
 
 
532 aa  504  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  53.51 
 
 
550 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  53.05 
 
 
536 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  54.62 
 
 
531 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  53.25 
 
 
527 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  55.12 
 
 
625 aa  490  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  54.92 
 
 
531 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  54.13 
 
 
532 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  49.72 
 
 
534 aa  472  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  46.77 
 
 
531 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  50.92 
 
 
539 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  46.62 
 
 
528 aa  438  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  47.58 
 
 
523 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  45.2 
 
 
550 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  47 
 
 
525 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  43.7 
 
 
539 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  43.7 
 
 
539 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  45.66 
 
 
522 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  41.79 
 
 
553 aa  361  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  43.31 
 
 
552 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  41.37 
 
 
569 aa  353  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  40.84 
 
 
538 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  39.92 
 
 
528 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  40.46 
 
 
569 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  38.89 
 
 
540 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  37.88 
 
 
524 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  36.53 
 
 
513 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  38.82 
 
 
557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  40.12 
 
 
562 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  38.82 
 
 
557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  38.63 
 
 
557 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  37.29 
 
 
545 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  38.67 
 
 
568 aa  282  9e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  38.45 
 
 
557 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  38.45 
 
 
557 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  38.45 
 
 
557 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  38.45 
 
 
557 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  38.26 
 
 
634 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  36.75 
 
 
533 aa  276  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  36.73 
 
 
545 aa  276  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  37.15 
 
 
545 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  37.62 
 
 
533 aa  274  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  37.55 
 
 
549 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  37.5 
 
 
539 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  37.48 
 
 
536 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  38.07 
 
 
543 aa  270  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  37.15 
 
 
546 aa  269  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  37.21 
 
 
512 aa  268  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  36.97 
 
 
546 aa  266  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  38.64 
 
 
538 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  36.97 
 
 
546 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  35.26 
 
 
541 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  35.66 
 
 
525 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  36.97 
 
 
546 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  36.97 
 
 
546 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  36.93 
 
 
526 aa  262  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  37.24 
 
 
542 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  34.9 
 
 
522 aa  260  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  37.06 
 
 
542 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  36.97 
 
 
546 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  35.01 
 
 
563 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  36.94 
 
 
552 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  34.51 
 
 
541 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  35.19 
 
 
529 aa  256  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  36.97 
 
 
546 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  34.78 
 
 
539 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  34.64 
 
 
525 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.2 
 
 
538 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  34.82 
 
 
538 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  35.66 
 
 
538 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  34.2 
 
 
534 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  33.52 
 
 
570 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  33.27 
 
 
545 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  33.52 
 
 
570 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  33.52 
 
 
570 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 
570 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  35.26 
 
 
536 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  32.69 
 
 
530 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  34.59 
 
 
529 aa  244  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  35.86 
 
 
531 aa  244  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  32.97 
 
 
570 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  33.33 
 
 
570 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  33.88 
 
 
563 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  33.33 
 
 
570 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  33.33 
 
 
570 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4154  gamma-glutamyltransferase 2  36.64 
 
 
531 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  32.46 
 
 
534 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  33.09 
 
 
564 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>