More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1413 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 531 aa  1095    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  49.33 
 
 		 532 aa  495  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  48.59 
 
 		 531 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  49.05 
 
 		 528 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  46.77 
 
 		 543 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  50 
 
 		 532 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  46.55 
 
 		 533 aa  461  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  47.37 
 
 		 539 aa  455  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  46.88 
 
 		 529 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  48.48 
 
 		 527 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  45.94 
 
 		 529 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  46.76 
 
 		 522 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  48.95 
 
 		 530 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  47.73 
 
 		 528 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  46.11 
 
 		 536 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  48.17 
 
 		 525 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  48.67 
 
 		 532 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  46.21 
 
 		 528 aa  425  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  44.59 
 
 		 550 aa  412  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  44.16 
 
 		 522 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  44.51 
 
 		 550 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  43.74 
 
 		 532 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  43.26 
 
 		 534 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  43.88 
 
 		 523 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  42.8 
 
 		 532 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  42.24 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  42.24 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  43.95 
 
 		 625 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  43.75 
 
 		 531 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  42.97 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  39.02 
 
 		 528 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  39.85 
 
 		 552 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  39.4 
 
 		 538 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  39.4 
 
 		 569 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  39.73 
 
 		 569 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  37.75 
 
 		 553 aa  317  5e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  35.5 
 
 		 524 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  34.42 
 
 		 513 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  34.82 
 
 		 540 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  33.45 
 
 		 541 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  32.35 
 
 		 512 aa  242  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  33.59 
 
 		 539 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  32.37 
 
 		 541 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  32.96 
 
 		 568 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  33.14 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  33.02 
 
 		 562 aa  237  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  32.16 
 
 		 533 aa  236  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  32.17 
 
 		 525 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  32.33 
 
 		 549 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  32.03 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  32.95 
 
 		 538 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  32.55 
 
 		 557 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  32.55 
 
 		 557 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  32.55 
 
 		 557 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  32.66 
 
 		 634 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  32.37 
 
 		 557 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  32.97 
 
 		 546 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  32.37 
 
 		 557 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  32.37 
 
 		 557 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  32.37 
 
 		 557 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  32.67 
 
 		 552 aa  226  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  32.35 
 
 		 534 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  32.36 
 
 		 542 aa  223  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  32.91 
 
 		 546 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  32.91 
 
 		 546 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  30.91 
 
 		 545 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  32.91 
 
 		 546 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  31.23 
 
 		 545 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  31.99 
 
 		 536 aa  220  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  32.12 
 
 		 542 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  32.1 
 
 		 534 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  30.36 
 
 		 545 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  32.59 
 
 		 527 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  31.84 
 
 		 563 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  32.19 
 
 		 546 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  32.52 
 
 		 531 aa  217  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  31.91 
 
 		 532 aa  217  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  29.89 
 
 		 530 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  32.19 
 
 		 546 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  32.36 
 
 		 539 aa  213  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  31.54 
 
 		 546 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  31.71 
 
 		 529 aa  209  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  30.55 
 
 		 564 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  30.54 
 
 		 525 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  31.88 
 
 		 543 aa  207  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  30.35 
 
 		 568 aa  207  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  30.39 
 
 		 533 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  29.93 
 
 		 563 aa  206  9e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  31.23 
 
 		 529 aa  206  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  31.91 
 
 		 537 aa  205  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  31.02 
 
 		 538 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  29.93 
 
 		 545 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  32.39 
 
 		 543 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  32.46 
 
 		 531 aa  204  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  31.6 
 
 		 542 aa  204  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  30.67 
 
 		 570 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  29.86 
 
 		 593 aa  203  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  30.78 
 
 		 541 aa  202  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  29.62 
 
 		 528 aa  202  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>