More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7208 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7208  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  620  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 351 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 351 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 351 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 367 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 351 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  40 
 
 		 351 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 351 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 351 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 367 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 349 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 349 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 349 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 353 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 355 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2690  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2661  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.583907  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2050  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2712  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2586  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4615  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0591659 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5689  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3753  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0276  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 571 aa  165  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1192  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 316 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000735562  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4131  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.82 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.23 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2760  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6606  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 294 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.015476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6475  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 299 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.820215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  33.77 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03330  putative transcriptional regulator  30.51 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6203  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200039  hitchhiker  0.00658058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1403  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5702  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0313513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5836  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3167  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000529291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0864  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2049  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3220  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000114793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0430  transcriptional regulator, LysR family  31.15 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716475 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1914  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000121317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  31.99 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3206  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000350263  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6679  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.653168  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3048  helix-turn-helix, Fis-type  32.77 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0203224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1852  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.387981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3332  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0789426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2962  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0155  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0458494  normal  0.226334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1958  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 307 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4777  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2877  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  33.96 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3014  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6209  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.92 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6316  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4614  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0515888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  28.38 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>