More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1147 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0418863  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.58 
 
 
292 aa  424  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000135991  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
302 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0679369  normal  0.411076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3376  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  30.88 
 
 
307 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3398  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.43 
 
 
307 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
303 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3072  UDP-glucose 4-epimerase  31.79 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3402  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  31.07 
 
 
307 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 
315 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0360339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.75 
 
 
346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 
346 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.388725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0633  epimerase protein  26.18 
 
 
290 aa  119  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1869  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.67 
 
 
306 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0242314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.78 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179855  normal  0.339449 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0596  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
280 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.483885  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1426  hypothetical protein  28.45 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0301389  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
285 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1128  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase/reductase  24.45 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.01 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.48 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.95 
 
 
373 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1332  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  24.28 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.77 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1967  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.21 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.95 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.76 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3528  CDP-abequose synthase  24.41 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000104251 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.46 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.973707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1703  CDP-abequose synthase  24.33 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000035805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.09 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.74 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.97 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.5 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.61 
 
 
281 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.32 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.59 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.19 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.36 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 
326 aa  67  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.19 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  18.55 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 
664 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  21.91 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0917  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.9 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.32 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.84 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.17 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.32 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.9 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033551  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.17 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.19 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.41 
 
 
335 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.86 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.65 
 
 
341 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0430992  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.86 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4601  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
298 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620561  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 
289 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42313  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.68 
 
 
353 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.49 
 
 
337 aa  62.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.4 
 
 
334 aa  62.4  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4463  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 
285 aa  62.4  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  21.53 
 
 
351 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  21.6 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0759  oxidoreductase Rmd  21.2 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0976196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.11 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.34 
 
 
332 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2436  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  21.2 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  21.2 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  21.07 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1710  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  21.2 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1041  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.31 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.15 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  25.09 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10430  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  20.32 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.18 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1659  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  21.2 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1867  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  21.2 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.9 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  20 
 
 
325 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0468  glutamyl-tRNA synthetase (glutamate--tRNA ligase; GluRS)  21.47 
 
 
352 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.208737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.35 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.2 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.17 
 
 
335 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179561  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.89 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02560  UDP-glucuronic acid decarboxylase Uxs1p  20.83 
 
 
410 aa  60.1  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.32 
 
 
336 aa  60.1  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>