268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4188 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4463  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.52 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 
283 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1128  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase/reductase  33.82 
 
 
287 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.06 
 
 
284 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
285 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
281 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1426  hypothetical protein  26.88 
 
 
282 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0301389  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0633  epimerase protein  28.47 
 
 
290 aa  99.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0360339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3376  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  25.31 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.58 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000135991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3398  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.28 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179855  normal  0.339449 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0596  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
280 aa  82  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.483885  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.74 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0679369  normal  0.411076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.74 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0418863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3402  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  23.05 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3072  UDP-glucose 4-epimerase  23.67 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1869  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0242314  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.05 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.16 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.388725 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  28.52 
 
 
324 aa  63.5  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 
324 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3804  putative UDP-glucose 4-epimerase  25.63 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.48 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.182648 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2436  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.5 
 
 
322 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0759  oxidoreductase Rmd  25.5 
 
 
322 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0976196  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.5 
 
 
322 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
317 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1710  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  25.5 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.31 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1659  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  25.5 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1867  putative GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  25.5 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10430  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.82 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
334 aa  56.6  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
302 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07621  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.36 
 
 
287 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
373 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.36 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.21 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017259  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
349 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
321 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  27.81 
 
 
337 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.64 
 
 
308 aa  53.1  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 
677 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
312 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3946  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase  22.86 
 
 
310 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
310 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  27.31 
 
 
289 aa  52.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
333 aa  52.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.34 
 
 
305 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  27.74 
 
 
330 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.54 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  23.61 
 
 
338 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.41 
 
 
333 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.74 
 
 
333 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.34 
 
 
331 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.18 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.56 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2809  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  24.3 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  27.3 
 
 
329 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2609  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  25.51 
 
 
343 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  0.0683488 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0785  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  23.25 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681891  normal  0.387484 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  26.67 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
343 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0337048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0856  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  22.61 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.7 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
326 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
347 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
347 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  26.75 
 
 
290 aa  50.1  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1033  putative epimerase  26.98 
 
 
309 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12941  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  19.52 
 
 
307 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0139899  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
320 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
310 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>