More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0596 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0596  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.483885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0633  epimerase protein  47.64 
 
 
290 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
315 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0360339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.86 
 
 
302 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179855  normal  0.339449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
346 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
346 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.388725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0679369  normal  0.411076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.93 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3398  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.96 
 
 
307 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3376  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  30.6 
 
 
307 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3402  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  30.6 
 
 
307 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3072  UDP-glucose 4-epimerase  30.6 
 
 
307 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 
283 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1128  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase/reductase  32.82 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
298 aa  118  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0418863  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000135991  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1426  hypothetical protein  34.27 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0301389  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
285 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1869  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
306 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0242314  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
281 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
284 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07621  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.62 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
322 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2900  paratose synthase  25.56 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00855353  normal  0.0646606 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.319703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3048  CDP-paratose synthetase  25.19 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.602683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.41 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4601  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620561  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  28.9 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.83 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  28.95 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.1 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10430  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.97 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
353 aa  65.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.47 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
326 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.81 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0776  UDP-glucose 4-epimerase  23.02 
 
 
281 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10863  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
331 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556189  normal  0.226818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0386  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0445125  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  27.12 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.29 
 
 
308 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11260  putative epimerase  27.41 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.48 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.72 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
327 aa  63.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.57 
 
 
330 aa  63.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 
323 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0431145  normal  0.15102 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
310 aa  62.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
294 aa  62.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244527  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.57 
 
 
294 aa  62.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  21.48 
 
 
308 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
328 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
306 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
327 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  27.47 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  25.71 
 
 
325 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.35 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>