More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0386 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0386  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
298 aa  604  9.999999999999999e-173  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3787  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.76 
 
 
298 aa  288  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.18 
 
 
303 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.48 
 
 
292 aa  271  8.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.37 
 
 
301 aa  257  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 
299 aa  225  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2271  CDP-abequose synthase  40.48 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000541202 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0776  UDP-glucose 4-epimerase  38.87 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10863  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2214  CDP-abequose synthase  38.44 
 
 
299 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.242503  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2315  CDP-abequose synthase  38.44 
 
 
299 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0279345 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2322  CDP-abequose synthase  38.38 
 
 
299 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360745  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2900  paratose synthase  37.15 
 
 
285 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00855353  normal  0.0646606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3048  CDP-paratose synthetase  36.81 
 
 
285 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.602683  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.81 
 
 
285 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.319703  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 
309 aa  169  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2429  paratose synthase  34.75 
 
 
279 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417691  hitchhiker  0.0000951168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1703  CDP-abequose synthase  25.48 
 
 
319 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000035805 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3528  CDP-abequose synthase  27.94 
 
 
319 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
329 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 
295 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
316 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0445125  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
305 aa  99  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
323 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  27.83 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
314 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
311 aa  95.9  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3398  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.32 
 
 
307 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
311 aa  93.2  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3402  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  25.24 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
313 aa  92.8  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3072  UDP-glucose 4-epimerase  26.01 
 
 
307 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2838  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.93 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3376  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  23.84 
 
 
307 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
309 aa  89.7  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.52 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
328 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.57 
 
 
302 aa  89  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0262  sugar nucleotide dehydratase  25.08 
 
 
317 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129808  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14001  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.81 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 
316 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
336 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.33 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.64 
 
 
317 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0900  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.44 
 
 
326 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.425817  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.3 
 
 
333 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase, NAD-dependent epimerase/dehydratase-related protein  26.14 
 
 
326 aa  86.3  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229105  normal  0.0838562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.87 
 
 
335 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.920861  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 
306 aa  85.9  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.16 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.16 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.93 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000109546 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  26.81 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.97 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  26.67 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.56 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.33 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.67 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.1 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.67 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.67 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.67 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2127  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.77 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.29 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0431145  normal  0.15102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41531  nad-dependent epimerase/dehydratase  24 
 
 
514 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  21.08 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.07 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  22.09 
 
 
593 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.12 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.366265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  26.75 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.07 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>