More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1542 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
335 aa  694    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.920861  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.88 
 
 
316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.88 
 
 
316 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.88 
 
 
316 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.02 
 
 
314 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2127  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.01 
 
 
314 aa  420  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.84 
 
 
312 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.84 
 
 
312 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2096  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  64.17 
 
 
314 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644928  hitchhiker  0.0000124933 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.31 
 
 
314 aa  401  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.467345  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.87 
 
 
314 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.39 
 
 
314 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.61 
 
 
312 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312565 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1041  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.5 
 
 
318 aa  335  9e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1700  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  41.97 
 
 
314 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231068  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.76 
 
 
313 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.874346 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0060  GDP-fucose synthetase  42.28 
 
 
308 aa  262  4.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.396896  normal  0.0281476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.45 
 
 
322 aa  262  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 
320 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.05 
 
 
309 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043091  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1828  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.42 
 
 
306 aa  259  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0122431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0035  GDP-fucose synthetase  41.18 
 
 
312 aa  258  8e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0178713 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.58 
 
 
321 aa  255  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.757489 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.47 
 
 
318 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.31 
 
 
323 aa  252  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429243  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.76 
 
 
312 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0627  GDP-fucose synthetase  43.71 
 
 
314 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1091  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.02 
 
 
309 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2350  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.08 
 
 
312 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.98 
 
 
347 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.34 
 
 
313 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000746713  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0619  GDP-fucose synthetase  38.41 
 
 
308 aa  246  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.4 
 
 
306 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.16 
 
 
308 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2842  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.99 
 
 
324 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2900  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  39.04 
 
 
311 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2695  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.13 
 
 
321 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0303782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.85 
 
 
313 aa  240  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.235303  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.69 
 
 
310 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.94 
 
 
321 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.384606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.3 
 
 
321 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.91 
 
 
314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.660712  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 
311 aa  239  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1315  NAD dependent epimerase/dehydratase  36.79 
 
 
332 aa  238  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 
337 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.28 
 
 
333 aa  238  8e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14001  putative fucose synthetase  36.66 
 
 
322 aa  238  8e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.881279  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.4 
 
 
316 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1147  GDP-L-fucose synthetase  41.1 
 
 
322 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.79 
 
 
305 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4219  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.58 
 
 
309 aa  235  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.58 
 
 
329 aa  235  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.46 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195142  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14001  putative fucose synthetase  37.5 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14451  putative fucose synthetase  38.49 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.47 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.144888  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4108  putative nucleotide di-P-sugar epimerase or dehydratase  39.81 
 
 
320 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5711  GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase /GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  42.37 
 
 
316 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.67 
 
 
376 aa  233  3e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000078339  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.99 
 
 
345 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.16 
 
 
319 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.38 
 
 
324 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4620  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.14 
 
 
312 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.16 
 
 
324 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 
356 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.435131  normal  0.526104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.38 
 
 
324 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.721722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
317 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.61 
 
 
314 aa  229  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.93 
 
 
331 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.482517 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0418  fucose synthetase family protein  39.93 
 
 
326 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0709177  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0361  fucose synthetase family protein  39.93 
 
 
326 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0252323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.09 
 
 
310 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1084  putative GDP-fucose synthetase  39.29 
 
 
316 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.81 
 
 
326 aa  227  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285763  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.88 
 
 
319 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00831994  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3371  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.59 
 
 
326 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3862  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  37.83 
 
 
319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38 
 
 
324 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38 
 
 
324 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5859  bifunctional GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase/GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  40.13 
 
 
333 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13691  putative fucose synthetase  35.76 
 
 
332 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2384  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
316 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73165  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 
321 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.350076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3040  GDP-L-fucose synthetase  37.26 
 
 
321 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.26 
 
 
321 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092333  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1253  GDP-L-fucose synthetase  37.26 
 
 
321 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000974466  hitchhiker  0.000000000000993367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.16 
 
 
316 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1282  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.05 
 
 
320 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4242  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.38 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0896711  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2092  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.03 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2730  GDP-L-fucose synthetase  38.34 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.94 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0771  bifunctional GDP-fucose synthetase: GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase and GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  36.54 
 
 
322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0933619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1775  GDP-L-fucose synthetase  38.71 
 
 
327 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1313  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.71 
 
 
320 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2290  GDP-L-fucose synthetase  36.83 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2233  GDP-L-fucose synthetase  36.83 
 
 
321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.487603  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2448  GDP-L-fucose synthetase  37.1 
 
 
321 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0192641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.81 
 
 
324 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.93 
 
 
331 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168438  normal  0.238091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>