More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0705 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
292 aa  602  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0386  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.48 
 
 
298 aa  261  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3787  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.59 
 
 
298 aa  254  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.92 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.13 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0776  UDP-glucose 4-epimerase  37.2 
 
 
281 aa  183  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10863  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.57 
 
 
299 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2214  CDP-abequose synthase  32.67 
 
 
299 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.242503  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2315  CDP-abequose synthase  32.67 
 
 
299 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0279345 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2322  CDP-abequose synthase  32.67 
 
 
299 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360745  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
309 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2900  paratose synthase  34.35 
 
 
285 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00855353  normal  0.0646606 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2271  CDP-abequose synthase  31.29 
 
 
293 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000541202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3048  CDP-paratose synthetase  33.67 
 
 
285 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.602683  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 
285 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.319703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2429  paratose synthase  29.11 
 
 
279 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417691  hitchhiker  0.0000951168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1703  CDP-abequose synthase  28.8 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000035805 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3528  CDP-abequose synthase  29.13 
 
 
319 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
295 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0445125  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  27.88 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  28.7 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.19 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  26.59 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.55 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  25.6 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  26.44 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0988  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  22.05 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  24.92 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  26.22 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  22.12 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  25.43 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.24 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  25.53 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  25.91 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  26.22 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2995  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  21.75 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.629705  hitchhiker  0.00222509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.78 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  25.71 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  25.81 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  27.16 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  26.02 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3398  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.78 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  25.53 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.19 
 
 
332 aa  68.9  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  25.91 
 
 
338 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.3 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  25.91 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  26.02 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.24 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.15 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  25.61 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12941  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.62 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0139899  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  25.91 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  25.23 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  25.23 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.45 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  25.73 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  25.23 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  24.92 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.56 
 
 
341 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.16 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
317 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  25.23 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  25.23 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.69 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  26.88 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  25.84 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0495  UDP-glucose 4-epimerase  23.62 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  24.92 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  26.79 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.4 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  25.07 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1234  UDP-glucose 4-epimerase  26.51 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0382166  normal  0.453706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  24.63 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.23 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3569  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.66 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.303688  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>