More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0031 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0030  outer membrane protein (porin)-like protein  91.51 
 
 
409 aa  723    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0031  outer membrane protein (porin)-like protein  100 
 
 
377 aa  770    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0029  outer membrane protein (porin)-like protein  90.43 
 
 
375 aa  708    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3214  outer membrane protein (porin)-like  90.45 
 
 
701 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84124  normal  0.834599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0048  porin  89.89 
 
 
375 aa  704    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0021  outer membrane protein (porin)-like protein  91.25 
 
 
409 aa  718    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0041  outer membrane protein (porin)-like  90.45 
 
 
435 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0044  putative porin  81.17 
 
 
386 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0256  outer membrane porin, putative  80.9 
 
 
406 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1849  putative outer membrane porin  81.17 
 
 
386 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0044  putative porin  81.17 
 
 
386 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3278  putative outer membrane porin  81.17 
 
 
386 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2703  putative outer membrane porin  81.17 
 
 
386 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2675  outer membrane porin, putative  81.12 
 
 
375 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0040  porin  80.85 
 
 
375 aa  614  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4041  porin Gram-negative type  68.72 
 
 
374 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3390  porin signal peptide protein  52.2 
 
 
376 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0795633  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3279  porin Gram-negative type  52.68 
 
 
375 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3601  porin Gram-negative type  52.39 
 
 
375 aa  348  8e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.939014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  30.95 
 
 
386 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  30.71 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  32.52 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  32.29 
 
 
390 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  31.86 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  30.79 
 
 
386 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  31.12 
 
 
354 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  30.24 
 
 
386 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  30.79 
 
 
386 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  30.79 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  32.04 
 
 
384 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  30.34 
 
 
381 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  32.04 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  32.04 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  32.04 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  32.04 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  32.04 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  30.81 
 
 
379 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  30.32 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  30.32 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  30.32 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  30.32 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  30.32 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  29.37 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  29.13 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  29.57 
 
 
381 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  30.48 
 
 
391 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  29.98 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  31.27 
 
 
379 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4019  OmpC family outer membrane porin  31.18 
 
 
373 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000373158  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  29.9 
 
 
394 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  30.83 
 
 
384 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  30.1 
 
 
383 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  29.03 
 
 
379 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  29.97 
 
 
391 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  31.13 
 
 
384 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  29.31 
 
 
383 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  28.88 
 
 
394 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  35.32 
 
 
359 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  29.85 
 
 
383 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  28.88 
 
 
394 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  28.88 
 
 
394 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  27.85 
 
 
385 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  31.41 
 
 
386 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  30.45 
 
 
365 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  32.41 
 
 
363 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  35.24 
 
 
359 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  31.75 
 
 
387 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  30.26 
 
 
359 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  29.72 
 
 
359 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  29.92 
 
 
374 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  30.28 
 
 
386 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.75 
 
 
358 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  26.67 
 
 
357 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  29.9 
 
 
359 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0680  porin Gram-negative type  30.83 
 
 
373 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  29.9 
 
 
359 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.75 
 
 
361 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  30.12 
 
 
376 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1936  OmpC family outer membrane porin  29.19 
 
 
369 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000467885  normal  0.0609572 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  29.05 
 
 
384 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  29.05 
 
 
384 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  30.31 
 
 
388 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  29.05 
 
 
384 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  29.16 
 
 
390 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  29.05 
 
 
384 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  29.05 
 
 
384 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  29.05 
 
 
384 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  29.05 
 
 
384 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  29.73 
 
 
381 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  29.74 
 
 
422 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  28.87 
 
 
382 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  33.33 
 
 
365 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  28.57 
 
 
380 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  33.33 
 
 
365 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  33.33 
 
 
365 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  30.43 
 
 
384 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  28.53 
 
 
414 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  29.3 
 
 
386 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  33.33 
 
 
365 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  30.43 
 
 
384 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>