More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A3278 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0041  outer membrane protein (porin)-like  80.53 
 
 		 435 aa  634    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1849  putative outer membrane porin  100 
 
 		 386 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2675  outer membrane porin, putative  99.73 
 
 		 375 aa  766    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0044  putative porin  100 
 
 		 386 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0256  outer membrane porin, putative  100 
 
 		 406 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0021  outer membrane protein (porin)-like protein  82.15 
 
 		 409 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3214  outer membrane protein (porin)-like  81.36 
 
 		 701 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84124  normal  0.834599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0031  outer membrane protein (porin)-like protein  81.7 
 
 		 377 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0030  outer membrane protein (porin)-like protein  82.94 
 
 		 409 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3278  putative outer membrane porin  100 
 
 		 386 aa  788    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0040  porin  98.93 
 
 		 375 aa  761    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2703  putative outer membrane porin  100 
 
 		 386 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0044  putative porin  99.74 
 
 		 386 aa  788    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0029  outer membrane protein (porin)-like protein  80.27 
 
 		 375 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0048  porin  80.27 
 
 		 375 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4041  porin Gram-negative type  71.2 
 
 		 374 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3390  porin signal peptide protein  54.95 
 
 		 376 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0795633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3601  porin Gram-negative type  53.8 
 
 		 375 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.939014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3279  porin Gram-negative type  54.08 
 
 		 375 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  30.62 
 
 		 368 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  31.12 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4019  OmpC family outer membrane porin  31.04 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000373158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  30.36 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0680  porin Gram-negative type  32.04 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  30.2 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  28.19 
 
 		 367 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  31.12 
 
 		 386 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  29.83 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  29.83 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  29.19 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  30.12 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  30.96 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3186  porin  30.75 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  31.22 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  29.93 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0400  porin  29.57 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.676022  normal  0.200977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  29.5 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.49 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  30.98 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  29.5 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5539  porin  30.65 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  29.5 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  31.43 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  28.46 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  30.46 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  28.95 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  29.5 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  29.47 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  29.68 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1936  OmpC family outer membrane porin  32.26 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000467885  normal  0.0609572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  33.86 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  30.31 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  30.88 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  29.25 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  31.54 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  29.25 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  31.79 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  31.54 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  29.57 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  28.61 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  29.25 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  29.25 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  31.12 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  28.15 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  32.17 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  29.36 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  31.54 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  31.54 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  31.54 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  30.65 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  31.03 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  30.25 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  30.73 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  29.54 
 
 		 386 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  30.85 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  29.12 
 
 		 383 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  30.91 
 
 		 399 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  27.19 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  31.27 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  35.24 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  28.57 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  28.03 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0189  porin Gram-negative type  31.3 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615373  hitchhiker  0.00390966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  29.78 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  27.8 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  29.23 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  27.54 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  30.46 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  27.84 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  27.54 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  27.54 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  28.32 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  29.78 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  28.32 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  28.32 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  30.53 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  28.3 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  29.77 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2320  outer membrane protein (porin)-like  28.53 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  28.97 
 
 		 384 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>