218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2911 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4172  pyridoxal-dependent decarboxylase  95.55 
 
 
450 aa  838    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2911  pyridoxal-dependent decarboxylase  100 
 
 
450 aa  893    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2955  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  81.42 
 
 
450 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4823  pyridoxal-dependent decarboxylase  95.55 
 
 
450 aa  838    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5130  pyridoxal-dependent decarboxylase  93.99 
 
 
450 aa  827    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3343  pyridoxal-dependent decarboxylase  95.55 
 
 
450 aa  838    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.748078  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6911  Pyridoxal-dependent decarboxylase  81.19 
 
 
451 aa  680    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3271  pyridoxal-dependent decarboxylase  92.89 
 
 
450 aa  822    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0411  Pyridoxal-dependent decarboxylase  69.78 
 
 
450 aa  630  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  73.03 
 
 
450 aa  625  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2732  pyridoxal-dependent decarboxylase  48.65 
 
 
463 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.238333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2702  pyridoxal-dependent decarboxylase  48.2 
 
 
463 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146813  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2746  pyridoxal-dependent decarboxylase  48.2 
 
 
463 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2558  Pyridoxal-dependent decarboxylase  44.9 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0178  Pyridoxal-dependent decarboxylase  48.08 
 
 
462 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2249  Pyridoxal-dependent decarboxylase  44.67 
 
 
471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198283  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4423  pyridoxal-dependent decarboxylase  45.71 
 
 
473 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1421  Pyridoxal-dependent decarboxylase  45.73 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000571165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1409  pyridoxal-dependent decarboxylase  42.86 
 
 
474 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1168  Pyridoxal-dependent decarboxylase  44.09 
 
 
482 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5923  pyridoxal-dependent decarboxylase  41.8 
 
 
483 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  0.358507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3871  pyridoxal-dependent decarboxylase  41.28 
 
 
480 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2377  pyridoxal-dependent decarboxylase  44.52 
 
 
518 aa  280  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2867  pyridoxal-dependent decarboxylase  42.98 
 
 
529 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121962  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3740  Pyridoxal-dependent decarboxylase  42.01 
 
 
455 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0339785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2266  Pyridoxal-dependent decarboxylase  38.95 
 
 
517 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1440  pyridoxal-dependent decarboxylase  36.82 
 
 
474 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2413  Pyridoxal-dependent decarboxylase  35.06 
 
 
459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7120  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.73 
 
 
466 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00363554  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1241  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.74 
 
 
466 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2531  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.54 
 
 
460 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3049  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.07 
 
 
471 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1181  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.51 
 
 
464 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1514  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.38 
 
 
467 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0060  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.66 
 
 
465 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.474391 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02091  tyrosine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04980)  32.1 
 
 
508 aa  160  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2925  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.84 
 
 
470 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.63 
 
 
529 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.75 
 
 
489 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5531  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  30.68 
 
 
502 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.35 
 
 
517 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.05 
 
 
479 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.65 
 
 
477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1102  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.34 
 
 
492 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.967255  normal  0.206901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.61 
 
 
495 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0909  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.81 
 
 
486 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4944  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.18 
 
 
486 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.326969  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0883  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.81 
 
 
486 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3209  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.97 
 
 
579 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1409  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.14 
 
 
478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.557357  hitchhiker  0.0000101933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.35 
 
 
495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4177  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.87 
 
 
484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.51833  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3338  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.95 
 
 
492 aa  120  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133892  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2223  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.1 
 
 
470 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.960692 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.78 
 
 
490 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.63 
 
 
488 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4871  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.06 
 
 
486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2160  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  25.57 
 
 
479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222222  normal  0.771411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4283  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.37 
 
 
486 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1038  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.37 
 
 
483 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2788  aromatic amino acid decarboxylase  24.24 
 
 
471 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  24.37 
 
 
479 aa  117  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.94 
 
 
496 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2867  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  24.24 
 
 
471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  26.74 
 
 
484 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3466  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.51 
 
 
470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.811665  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1334  aromatic amino acid decarboxylase  24.24 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2033  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.68 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376208  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.48 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  25.47 
 
 
491 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1334  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.34 
 
 
497 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1738  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.47 
 
 
474 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0114  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.67 
 
 
480 aa  113  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15522  normal  0.0242531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3163  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.15 
 
 
478 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491116  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  25.94 
 
 
510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0076  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.45 
 
 
458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03010  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  30.9 
 
 
442 aa  110  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  25.58 
 
 
484 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  25.58 
 
 
484 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  25.58 
 
 
484 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3364  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.12 
 
 
470 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6192  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.16 
 
 
492 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.478239  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2552  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.68 
 
 
470 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00803752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.43 
 
 
551 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.59 
 
 
480 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1238  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.6 
 
 
486 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1832  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.3 
 
 
475 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.536749  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  25.28 
 
 
484 aa  107  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1428  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.37 
 
 
476 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1957  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.96 
 
 
476 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0071  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.33 
 
 
474 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.621553  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3330  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.99 
 
 
503 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.405304  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  22.08 
 
 
461 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3501  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.96 
 
 
464 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0214  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.89 
 
 
527 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  26.86 
 
 
543 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.34 
 
 
470 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.31 
 
 
534 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2740  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.32 
 
 
530 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.63 
 
 
511 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>