More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6312 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  100 
 
 
338 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  97.62 
 
 
338 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  97.62 
 
 
338 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  75.08 
 
 
339 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  70.06 
 
 
338 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  70.53 
 
 
323 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  68.97 
 
 
323 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  55.13 
 
 
343 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  51.95 
 
 
334 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  53.1 
 
 
346 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  53.82 
 
 
352 aa  357  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  53.92 
 
 
346 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  55.39 
 
 
346 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  45.56 
 
 
338 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.91 
 
 
338 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  45.03 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.08 
 
 
338 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  47.27 
 
 
328 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  46.77 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.31 
 
 
339 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  46.11 
 
 
334 aa  262  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.91 
 
 
339 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.63 
 
 
339 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.39 
 
 
348 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  44.87 
 
 
354 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
340 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.71 
 
 
341 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  44.71 
 
 
341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  44.85 
 
 
348 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  42.26 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  40.8 
 
 
334 aa  239  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  44.31 
 
 
334 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.5 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  43.12 
 
 
314 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  42.12 
 
 
326 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
339 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
339 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.76 
 
 
334 aa  216  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.98 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.48 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  38.25 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.48 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.16 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.25 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  43.04 
 
 
313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  44.41 
 
 
328 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.95 
 
 
336 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.95 
 
 
336 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.95 
 
 
336 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  37.65 
 
 
336 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
334 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.04 
 
 
336 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.67 
 
 
350 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  40.87 
 
 
378 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  41.85 
 
 
333 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.55 
 
 
373 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  37.27 
 
 
395 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.53 
 
 
337 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  46.21 
 
 
309 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.59 
 
 
345 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  39.27 
 
 
322 aa  182  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  37.97 
 
 
308 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  36.69 
 
 
356 aa  182  7e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  37.03 
 
 
332 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.09 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  29.48 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  31.8 
 
 
316 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  27.74 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  30.18 
 
 
323 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  33.78 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  27.13 
 
 
312 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  27.88 
 
 
412 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  27.44 
 
 
317 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  26.69 
 
 
323 aa  102  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  28.26 
 
 
309 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  28.95 
 
 
326 aa  93.2  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  27.22 
 
 
326 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  29.57 
 
 
325 aa  89.7  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  29.08 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  28.7 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  24.61 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1063  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.78 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.730153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  27.22 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0782  aldo/keto reductase  29.39 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12920  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  28.92 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.55 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5904  aldo/keto reductase  28.12 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407545  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1557  aldo/keto reductase  25.08 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1588  aldo/keto reductase  25.08 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.379081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.15 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3165  aldo/keto reductase  26.95 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1455  aldo/keto reductase  25.88 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  27.13 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.63 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  25.99 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  26.09 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.63 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  25.45 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  26.4 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>