More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4297 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  100 
 
 
346 aa  704    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  80.52 
 
 
346 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  80.23 
 
 
346 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  53.39 
 
 
339 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  54.57 
 
 
338 aa  361  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  54.49 
 
 
323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  54.8 
 
 
323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  53.27 
 
 
334 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  51.05 
 
 
338 aa  339  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  49.26 
 
 
352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  50.45 
 
 
338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  49.55 
 
 
339 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  53.1 
 
 
338 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  51.92 
 
 
338 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  51.92 
 
 
338 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  49.85 
 
 
338 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  46.65 
 
 
343 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  48.91 
 
 
334 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  46.9 
 
 
328 aa  291  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  50.49 
 
 
339 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  48.28 
 
 
339 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  49.19 
 
 
339 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  48.15 
 
 
329 aa  282  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
340 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  43.9 
 
 
334 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.71 
 
 
341 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
341 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  42.6 
 
 
354 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  41.14 
 
 
348 aa  250  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.85 
 
 
348 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.96 
 
 
313 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
322 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  42.25 
 
 
340 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  41.98 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.74 
 
 
321 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  45.32 
 
 
328 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  43.2 
 
 
333 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.35 
 
 
336 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.12 
 
 
334 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.79 
 
 
336 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  41.28 
 
 
334 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.79 
 
 
336 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.25 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.21 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  41.21 
 
 
339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  41.21 
 
 
339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.46 
 
 
336 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  39.16 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  41.25 
 
 
308 aa  215  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.58 
 
 
373 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  38.86 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.86 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.86 
 
 
336 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.86 
 
 
336 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
334 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
326 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.55 
 
 
334 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  37.69 
 
 
378 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.37 
 
 
337 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.14 
 
 
350 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  38.99 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  35.28 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  44.52 
 
 
309 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  34.8 
 
 
356 aa  169  6e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  28.62 
 
 
312 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
316 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  29.12 
 
 
319 aa  132  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  28.39 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.53 
 
 
323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  31.01 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  29.04 
 
 
323 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  28.53 
 
 
323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  26.59 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  30.09 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  26.65 
 
 
412 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  28.79 
 
 
326 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  25.99 
 
 
308 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  28.49 
 
 
331 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.3 
 
 
308 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  28.45 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  26.61 
 
 
309 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  26.63 
 
 
327 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.81 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.81 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  28.14 
 
 
329 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  23.82 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.81 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.63 
 
 
311 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  26.25 
 
 
312 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.81 
 
 
311 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.22 
 
 
311 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25 
 
 
311 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  29.72 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  25 
 
 
328 aa  93.2  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3049  aldo/keto reductase  27.41 
 
 
323 aa  92.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  22.59 
 
 
314 aa  92.4  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  28 
 
 
331 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>