More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3075 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  100 
 
 		 350 aa  718    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  66.67 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  54.6 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.53 
 
 		 336 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.51 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.51 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  38.51 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.21 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  38.21 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.21 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.24 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  38.39 
 
 		 340 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.91 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.91 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 339 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 339 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.02 
 
 		 339 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  40 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  40.79 
 
 		 329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  38.41 
 
 		 346 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.88 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  40.31 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  38.65 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  37.8 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  39.38 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  38.67 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.17 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  39.17 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  35.83 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  35.19 
 
 		 323 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  35.14 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  39.69 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  37.72 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  37.04 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  37.04 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  35.77 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  37.8 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  36.39 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  36.59 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  36.59 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  38.41 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.49 
 
 		 352 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  36.62 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  33.85 
 
 		 334 aa  182  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  35.67 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  36.76 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  35.54 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  32.14 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  39.06 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  34.89 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  35.24 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  38.05 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.52 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  33.64 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  35.94 
 
 		 326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  34.01 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  34.48 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  32.93 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  32.13 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  36.63 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  34.39 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  33.64 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  34.06 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  35.94 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  27.06 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  27.39 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  27.42 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  26.6 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  26.86 
 
 		 323 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.48 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  27.13 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  26.35 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  26.38 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  28.07 
 
 		 356 aa  96.3  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  27.67 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  22.58 
 
 		 311 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0842  aryl-alcohol dehydrogenase  24.38 
 
 		 302 aa  92.8  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  25.66 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  22.58 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  22.58 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  22.58 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  22.58 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  31.27 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  22.29 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  27.54 
 
 		 312 aa  89.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  21.99 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  21.7 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  21.7 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  28.75 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  26.62 
 
 		 323 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  26.27 
 
 		 327 aa  85.9  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  28.43 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  25.5 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1876  aldo/keto reductase  30.19 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0609138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  26.53 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  20.82 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  26.1 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  25.34 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  27.11 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4229  lolS protein  23.87 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>