More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5474 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  100 
 
 		 323 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  86.07 
 
 		 323 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  86.07 
 
 		 338 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  71.56 
 
 		 339 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  71.16 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  71.16 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  70.53 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  56.92 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  54.8 
 
 		 346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  56.17 
 
 		 346 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  56.79 
 
 		 346 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  51.53 
 
 		 352 aa  332  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  51.52 
 
 		 343 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  45.96 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  46.75 
 
 		 339 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.2 
 
 		 338 aa  295  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  46.27 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  46.91 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  48.18 
 
 		 354 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.54 
 
 		 339 aa  271  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  48.18 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  45.34 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  48.92 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  46.42 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.67 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.43 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.79 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  43.96 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  40.71 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  41.77 
 
 		 334 aa  236  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  39.57 
 
 		 340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  43.26 
 
 		 314 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  42.15 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  45.23 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.84 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.84 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  43 
 
 		 313 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  40.49 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  40.49 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.49 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.38 
 
 		 373 aa  215  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.61 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  37.61 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.94 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  42.37 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  42.46 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  37.31 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  41.3 
 
 		 378 aa  212  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.46 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.31 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.31 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.31 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  42.5 
 
 		 333 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.65 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.19 
 
 		 350 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.12 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  38.68 
 
 		 308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  37.85 
 
 		 337 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  46.74 
 
 		 309 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  36.73 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  36.56 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  38.44 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  37.7 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.06 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  30.22 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.6 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  30.98 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  27.59 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  28.34 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.09 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  25.6 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  26.14 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  27.94 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  25.97 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  28.12 
 
 		 412 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1557  aldo/keto reductase  25.48 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1588  aldo/keto reductase  25.48 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.379081  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  27.8 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1455  aldo/keto reductase  27.06 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  29.56 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  29.25 
 
 		 304 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  26.18 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  28.3 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4005  lolS protein  27.99 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3838  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.99 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4318  oxidoreductase  27.99 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4120  lolS protein  27.99 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000109156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4229  lolS protein  27.33 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3852  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.3 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95974  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1063  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.75 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.730153  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  27.27 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  29.26 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  25.84 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  27.08 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3049  aldo/keto reductase  26.2 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1373  aldo/keto reductase  24.84 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  25.81 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4165  lolS protein  26.73 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0199  aldo/keto reductase  25.16 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>