More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0396 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  100 
 
 		 309 aa  598  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  67.54 
 
 		 314 aa  356  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  60.07 
 
 		 313 aa  328  7e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  58.28 
 
 		 373 aa  322  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  57.14 
 
 		 321 aa  315  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  57.1 
 
 		 326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  60.13 
 
 		 333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  58.75 
 
 		 322 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  58.96 
 
 		 334 aa  288  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  55.48 
 
 		 328 aa  286  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  48.41 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  47.77 
 
 		 354 aa  261  8e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  49.67 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  49.67 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  50.79 
 
 		 348 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  46.65 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.82 
 
 		 341 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  48.51 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.95 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  45.95 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  47.9 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  47.6 
 
 		 338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  47.6 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  44.19 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  54.55 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.83 
 
 		 346 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.95 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  48.33 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.44 
 
 		 346 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  46.5 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.23 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  43.18 
 
 		 334 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  43.41 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  42.32 
 
 		 340 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.48 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  45.08 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.52 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.44 
 
 		 352 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.16 
 
 		 339 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  48.23 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  39.81 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  42.37 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.43 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.43 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.95 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  42.62 
 
 		 334 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  38.36 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  45.05 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  45.05 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  38.17 
 
 		 336 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.17 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.69 
 
 		 338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.85 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.85 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.75 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.85 
 
 		 336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  39.24 
 
 		 378 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.75 
 
 		 337 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.94 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.56 
 
 		 339 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  38.94 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  38.94 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  36.88 
 
 		 395 aa  175  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.19 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  38.19 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  31.76 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  33.66 
 
 		 322 aa  158  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  35.19 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  35.74 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  35.86 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  38.14 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  33.11 
 
 		 323 aa  146  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  36.81 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  37.33 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  32.88 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  33.77 
 
 		 412 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  33.99 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  30.46 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.08 
 
 		 327 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  30.46 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  30.23 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  27.67 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  27.67 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  28.76 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.67 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.67 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  30.07 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  27.54 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0842  aryl-alcohol dehydrogenase  27.87 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  27.36 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.36 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7726  aldo/keto reductase  32.63 
 
 		 347 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.36 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.03 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  29.84 
 
 		 333 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  29.61 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  25.56 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1557  aldo/keto reductase  25.84 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  31.79 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>