More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6096 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 343 aa  705    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  72.3 
 
 		 352 aa  513  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  51.75 
 
 		 338 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  55.85 
 
 		 338 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  55.85 
 
 		 338 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  50.44 
 
 		 339 aa  332  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  49.85 
 
 		 346 aa  331  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  51.52 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  51.07 
 
 		 323 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  55.13 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  51.02 
 
 		 346 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  47.95 
 
 		 334 aa  318  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.65 
 
 		 346 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.19 
 
 		 338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  42.98 
 
 		 338 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  45.16 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  42.03 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.57 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  42.73 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  43.87 
 
 		 329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.34 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  41.76 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.18 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  41.76 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.59 
 
 		 339 aa  248  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.59 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  41.57 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  39.77 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  40.31 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  39.76 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.74 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  42.68 
 
 		 322 aa  222  9e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  39.58 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  39.77 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.06 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  37.69 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.97 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.97 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.39 
 
 		 336 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.39 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.39 
 
 		 336 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  37.39 
 
 		 336 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.39 
 
 		 336 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  38.42 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  38.07 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.72 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  38.72 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  37.23 
 
 		 332 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.18 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  36.55 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  37.17 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  37.88 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  37.88 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  36.92 
 
 		 328 aa  188  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  38.28 
 
 		 345 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  34.97 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  33.95 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.14 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  37.5 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  35.78 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  40.54 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  33.53 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  32.02 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  31.56 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  31.47 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  30.65 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  28.14 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  28.06 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.72 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  28.44 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  30.38 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  28.06 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  26.13 
 
 		 412 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  25.78 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  29.86 
 
 		 370 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  25.07 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  29.86 
 
 		 351 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  26.05 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.15 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  24.4 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  28.29 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.3 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  28.29 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  22.92 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  28.69 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.14 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.14 
 
 		 311 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  27.27 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  25 
 
 		 326 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  25 
 
 		 326 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25 
 
 		 326 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.14 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.14 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.14 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  27.35 
 
 		 342 aa  93.2  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  25 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  24.62 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>