More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1547 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  100 
 
 
348 aa  688    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  52.94 
 
 
329 aa  311  7.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  48.08 
 
 
339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  48.2 
 
 
340 aa  301  8.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  50.61 
 
 
341 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  50.61 
 
 
341 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  50.45 
 
 
346 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  49.7 
 
 
354 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  48.53 
 
 
338 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  49.23 
 
 
323 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  47.29 
 
 
338 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  48.92 
 
 
323 aa  289  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  47.01 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.85 
 
 
339 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.85 
 
 
346 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  49.24 
 
 
346 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  46.06 
 
 
338 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.4 
 
 
352 aa  265  8e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.02 
 
 
339 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.02 
 
 
339 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  45.96 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  47.65 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  46.39 
 
 
338 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  46.39 
 
 
338 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.61 
 
 
338 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  43.77 
 
 
334 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  43.69 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  41.74 
 
 
343 aa  241  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  45.45 
 
 
348 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.57 
 
 
339 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  44.81 
 
 
334 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  42.04 
 
 
328 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  45.62 
 
 
314 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  40.79 
 
 
322 aa  219  7e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  37.46 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.96 
 
 
336 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.46 
 
 
336 aa  215  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.44 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  37.46 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  40 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.17 
 
 
336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.17 
 
 
336 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.17 
 
 
336 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  43.32 
 
 
334 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.73 
 
 
339 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.32 
 
 
334 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.84 
 
 
336 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.84 
 
 
336 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.67 
 
 
334 aa  209  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
339 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
339 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.48 
 
 
337 aa  206  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
326 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  39.87 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  48.26 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  44.55 
 
 
328 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.99 
 
 
345 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  39.41 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  42.01 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  37.97 
 
 
378 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  37.12 
 
 
308 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.81 
 
 
373 aa  179  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  38.84 
 
 
322 aa  176  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.63 
 
 
350 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  34.14 
 
 
395 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  31.87 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
319 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.51 
 
 
299 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  32.89 
 
 
325 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  25.39 
 
 
322 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  27.76 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  29.39 
 
 
323 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.18 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  26.28 
 
 
312 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  29.87 
 
 
412 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  25.81 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3576  oxidoreductase  24.26 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  28.95 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  29.25 
 
 
326 aa  93.6  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  26.18 
 
 
314 aa  92.8  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  25.96 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.08 
 
 
311 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.08 
 
 
311 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.08 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.08 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  24.02 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.08 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  23.85 
 
 
311 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  23.24 
 
 
311 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25 
 
 
311 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  24.27 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  29.14 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3049  aldo/keto reductase  24.6 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  25.55 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  24.2 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  23.24 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  25 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2283  aldo/keto reductase  28.26 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0203552  normal  0.105124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  25.32 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1066  aldo/keto reductase  28.35 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.115194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>