More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3434 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  100 
 
 		 323 aa  656    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  91.46 
 
 		 323 aa  592  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  67.61 
 
 		 322 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  70.59 
 
 		 319 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  50.67 
 
 		 316 aa  318  9e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  46.23 
 
 		 412 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  39.67 
 
 		 326 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  34.91 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  36.59 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  31.56 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  32.82 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  31.76 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  33.23 
 
 		 321 aa  146  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  36.48 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  32.72 
 
 		 339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  32.23 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.31 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  33.72 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  33.93 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  29.67 
 
 		 339 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  36.76 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  32.35 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  31.9 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  35.08 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  33.54 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.67 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  32.56 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.67 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  31.43 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  34.5 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  30.36 
 
 		 340 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  32.27 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.67 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  30.67 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  30.67 
 
 		 336 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  30.98 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.67 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.37 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.37 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  28.57 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  32.11 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  35.19 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  34.73 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  31.4 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  30.09 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.53 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  29.21 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  38.73 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  33.02 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  30.75 
 
 		 338 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  33.22 
 
 		 317 aa  125  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.91 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  29.6 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.39 
 
 		 373 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.36 
 
 		 339 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  31.92 
 
 		 334 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  31.92 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.3 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  29.75 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  30.28 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  30.28 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  30 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  30 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.13 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  27.96 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.09 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  31.17 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  31.46 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  31.47 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  29.45 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.88 
 
 		 336 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  29.15 
 
 		 376 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  26.38 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  29.81 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  27.53 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  31.44 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  29.66 
 
 		 370 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.3 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.86 
 
 		 350 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  27.62 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  27.97 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.97 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  27.62 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.62 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  27.97 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  29.39 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.8 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.62 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  27.58 
 
 		 351 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  27.58 
 
 		 351 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4981  aldo/keto reductase  30.54 
 
 		 270 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  26.6 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  27.91 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  27.97 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  28.62 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  29.29 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  25.88 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>