More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2224 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  100 
 
 
326 aa  642    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  57.79 
 
 
325 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  42.41 
 
 
322 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  39.33 
 
 
316 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  40.39 
 
 
319 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  42.48 
 
 
412 aa  215  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.67 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  39.67 
 
 
323 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  30.03 
 
 
312 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  30.7 
 
 
334 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  32.37 
 
 
313 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  34.09 
 
 
309 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  28.44 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  33.33 
 
 
299 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  30.49 
 
 
332 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.58 
 
 
338 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  30.51 
 
 
338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  31.37 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  29.97 
 
 
338 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  30.03 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  32.8 
 
 
314 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
323 aa  108  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  34.37 
 
 
345 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  29.38 
 
 
339 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  30.91 
 
 
326 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  32.51 
 
 
308 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  28.09 
 
 
346 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.79 
 
 
346 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  29.34 
 
 
339 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  29.47 
 
 
322 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  27.86 
 
 
354 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  27.96 
 
 
322 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  27.86 
 
 
341 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  25.46 
 
 
340 aa  100  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.08 
 
 
352 aa  99.4  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  28.71 
 
 
328 aa  99.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  29.86 
 
 
373 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  27.94 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  27.08 
 
 
376 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.09 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  30.09 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  27.78 
 
 
346 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
333 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.02 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  26.52 
 
 
338 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  29.19 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  28.88 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  32.94 
 
 
309 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  29.47 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  28.22 
 
 
356 aa  89.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  26.13 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  28.83 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  26.87 
 
 
339 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.65 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  27.65 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1418  aldo/keto reductase  27.71 
 
 
324 aa  86.3  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  25.44 
 
 
315 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.69 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  27.69 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  27.69 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  26.13 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  27.69 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  27.69 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.69 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.69 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.69 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.38 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
378 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  33.64 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  27.02 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  27.38 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.32 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  32.8 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.02 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  26.01 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.02 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  24.26 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  27.62 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.62 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  25.73 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  27.55 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3357  aldo/keto reductase  25.68 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.38 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.73 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.73 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.25 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  25.84 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.25 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  25.93 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  27.51 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  25.84 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  27.3 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0351  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.88 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4823  aldo/keto reductase  27.88 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  27.3 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2991  aldo/keto reductase  26.83 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.72 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.3 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  26.32 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>