More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0799 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  100 
 
 		 312 aa  642    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  51.43 
 
 		 317 aa  334  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  43.39 
 
 		 323 aa  271  8.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  31.61 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  31.49 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  31.03 
 
 		 348 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  30.49 
 
 		 339 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.22 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  29.52 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  31.01 
 
 		 308 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  32 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  26.88 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.62 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.19 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  32.03 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  27.78 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  29.84 
 
 		 346 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  30.8 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  30.03 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  27.19 
 
 		 338 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  30.07 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  28.33 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  28.31 
 
 		 333 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  27.56 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  31.42 
 
 		 306 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  30.28 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.21 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  27.95 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  26.47 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.61 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  27.24 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07621  L-galactose dehydrogenase (L-GalDH), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04140)  33.76 
 
 		 459 aa  125  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  29.55 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  31.19 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  28.22 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  28.71 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  27.72 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  29.51 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  27.69 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  28.53 
 
 		 354 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  27.48 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  27.94 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  26.17 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  29.6 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  27.22 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  29.91 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  31.91 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.33 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  25.62 
 
 		 336 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  28.16 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  27.97 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  27.95 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.64 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09457  conserved hypothetical protein  33.84 
 
 		 486 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0221624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.62 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  27.78 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  28.2 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.24 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.24 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.28 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  28.28 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.28 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.28 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.48 
 
 		 339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  29.68 
 
 		 333 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  26.35 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  27.95 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  24.68 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  30.34 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04250  expressed protein  30.42 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.144806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  27.69 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  26.69 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  30.22 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  28.81 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58212  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  29.26 
 
 		 362 aa  113  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2071  aldo/keto reductase  27.64 
 
 		 316 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0765419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  26.43 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  29.51 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  25.71 
 
 		 352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  25.97 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  28.72 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4005  lolS protein  28.52 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3838  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.52 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6427  aldo/keto reductase  30.62 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4318  oxidoreductase  28.52 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3125  aldo/keto reductase  30.29 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2988  aldo/keto reductase  30.29 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378193  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4229  lolS protein  28.62 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4120  lolS protein  28.52 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000109156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  26.21 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14600  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  29.49 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  26.02 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3852  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.08 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95974  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  27.38 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  28.33 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  25.78 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  25.83 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3566  aldo/keto reductase  24.84 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>