More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58212 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_58212  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  100 
 
 
362 aa  744    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07621  L-galactose dehydrogenase (L-GalDH), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04140)  39.05 
 
 
459 aa  217  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09457  conserved hypothetical protein  39.69 
 
 
486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0221624  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04250  expressed protein  30.91 
 
 
412 aa  134  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.144806  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  31.37 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  29.26 
 
 
312 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  32.37 
 
 
317 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  40 
 
 
351 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4981  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.48 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  40.17 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.78 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  36.88 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  38.52 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4932  aldo/keto reductase  40.48 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  39.68 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4804  aldo/keto reductase  40.48 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5727  hypothetical protein  34.3 
 
 
270 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  35.29 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  34 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66010  hypothetical protein  36.31 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0637322  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44630  Aldo/keto reductase family protein  37.31 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0940461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4981  aldo/keto reductase  39.37 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480582  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  27.35 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0534  aldo/keto reductase  38.89 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.043929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  34.66 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.76 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.76 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  30.95 
 
 
334 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  35.71 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  33.59 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  23.65 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  33.81 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.99 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  30.99 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.99 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.99 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  34.3 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  33.57 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  30.99 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.99 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  26.72 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  34.93 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  35.77 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  35.77 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0821  aldo/keto reductase  36.59 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.146536 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1681  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.26 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  26.69 
 
 
340 aa  69.3  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  33.78 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  36.03 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  35.71 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  32.87 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  35 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  32.87 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4507  oxidoreductase (related to aryl-alcohol dehydrogenase)-like protein  34.13 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.12 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1374  aldo/keto reductase  28.08 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0615  aldo/keto reductase  37.3 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  30.13 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  33.78 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.4 
 
 
311 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.4 
 
 
311 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.4 
 
 
311 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3488  putative aldo/keto reductase  33.11 
 
 
332 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0487962 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.4 
 
 
311 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  25.78 
 
 
316 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.4 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl252  putative aldo/keto reductase  32.26 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00286495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  33.1 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.4 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1709  aldo/keto reductase  33.57 
 
 
305 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1959  aldo/keto reductase  30.53 
 
 
251 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  34.15 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  34.15 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  30.46 
 
 
334 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.46 
 
 
334 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  34.15 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  33.1 
 
 
294 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.25 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  36.64 
 
 
311 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  23.08 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  27.55 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  36.84 
 
 
314 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.61 
 
 
315 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  30.34 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  24.83 
 
 
322 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1782  oxidoreductase  27.54 
 
 
320 aa  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.61 
 
 
334 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.61 
 
 
315 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0714  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
290 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1742  aldo/keto reductase  33.05 
 
 
305 aa  63.5  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.61 
 
 
334 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.61 
 
 
334 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.51 
 
 
327 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.61 
 
 
334 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0946  aldo/keto reductase  32.03 
 
 
265 aa  63.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.837346  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  33.85 
 
 
312 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1786  aldo/keto reductase  27.4 
 
 
280 aa  63.2  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.672029  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  33.85 
 
 
312 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>