More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3488 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3488  putative aldo/keto reductase  100 
 
 		 332 aa  683    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0487962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  49.37 
 
 		 330 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  47.59 
 
 		 328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  48.43 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  48.26 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  47.77 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  46.99 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.26 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  46.69 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  44.85 
 
 		 340 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  47.81 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  46.06 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  44.13 
 
 		 328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  43.47 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  45.91 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  45.91 
 
 		 326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  46.75 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  46.06 
 
 		 330 aa  282  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  44.55 
 
 		 328 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  44.97 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  45.62 
 
 		 331 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  44.28 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  44.03 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  44.94 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  42.33 
 
 		 328 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  43.91 
 
 		 491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  43.48 
 
 		 317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  43.79 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  45.54 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  43.56 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  42.68 
 
 		 328 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  41.82 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0404  aldo/keto reductase  46.93 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  42.64 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  43.91 
 
 		 449 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  44.11 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  48.26 
 
 		 320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  44.34 
 
 		 331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  41.67 
 
 		 335 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2669  aldo/keto reductase  44.15 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000580906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  42.72 
 
 		 329 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  43.47 
 
 		 333 aa  265  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  41.72 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  41.72 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  43.33 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  43.21 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  41.56 
 
 		 328 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  43.03 
 
 		 329 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3924  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 326 aa  261  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.281437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  43.65 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  42.77 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  42.15 
 
 		 331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  42.67 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1438  aldo/keto reductase  41.67 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.020448  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2012  aryl-alcohol dehydrogenase  42.12 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  42.11 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  40.87 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3883  aldo/keto reductase  40.56 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  44.82 
 
 		 330 aa  255  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  41.61 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  44.1 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  42.12 
 
 		 331 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0302  aldo/keto reductase  42.15 
 
 		 334 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 332 aa  251  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4943  aldo/keto reductase  42.2 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  41.32 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  41.05 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  41.82 
 
 		 331 aa  249  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3748  aldo/keto reductase  44.1 
 
 		 317 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  41.61 
 
 		 330 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2093  aldo/keto reductase  43.79 
 
 		 322 aa  248  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  41.69 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2317  aldo/keto reductase  43.35 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2025  aldo/keto reductase  42.07 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  42.17 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  44.62 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  43.33 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  41.56 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  42.19 
 
 		 325 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2860  aldo/keto reductase  41.74 
 
 		 331 aa  245  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0184279  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  42.26 
 
 		 335 aa  245  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  41.27 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4441  aldo/keto reductase  39.38 
 
 		 341 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363717  normal  0.416804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  42.04 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2325  aldo/keto reductase  41.69 
 
 		 336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  41.28 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2873  hypothetical protein  40.3 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  40.57 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  42.77 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4574  aldo/keto reductase  41.43 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.330115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  42.07 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  41.09 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  41.34 
 
 		 333 aa  238  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3183  aldo/keto reductase  41.62 
 
 		 330 aa  238  8e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  40.18 
 
 		 331 aa  238  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  42.14 
 
 		 329 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.44 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  40.91 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  40.87 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>