More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4574 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4574  aldo/keto reductase  100 
 
 
319 aa  655    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.330115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0800  aldo/keto reductase  53.27 
 
 
323 aa  311  5.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  43.56 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  46.36 
 
 
340 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
328 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  42.38 
 
 
330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  44.79 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  43.07 
 
 
332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  43.69 
 
 
328 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  45.82 
 
 
328 aa  242  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  40.8 
 
 
328 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3488  putative aldo/keto reductase  41.43 
 
 
332 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0487962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  41.28 
 
 
326 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  42.33 
 
 
330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  42.02 
 
 
331 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  41.46 
 
 
326 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  40.9 
 
 
330 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
331 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3924  aldo/keto reductase  41.07 
 
 
326 aa  238  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.281437  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  42.6 
 
 
330 aa  238  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  40.91 
 
 
330 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  41.32 
 
 
317 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  42.94 
 
 
328 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  40 
 
 
335 aa  235  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  41.28 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  43.96 
 
 
360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  42.35 
 
 
449 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  44.11 
 
 
332 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  42.36 
 
 
329 aa  232  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  41.77 
 
 
328 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0302  aldo/keto reductase  40.73 
 
 
334 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  41.03 
 
 
331 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  41.77 
 
 
328 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.49 
 
 
331 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4441  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
341 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363717  normal  0.416804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  39.2 
 
 
328 aa  229  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  39.33 
 
 
328 aa  228  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
331 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  42.32 
 
 
328 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.43 
 
 
325 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  42.5 
 
 
328 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.55 
 
 
327 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
320 aa  225  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2025  aldo/keto reductase  43.19 
 
 
334 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  42.73 
 
 
329 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1438  aldo/keto reductase  42.59 
 
 
333 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.020448  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  40.79 
 
 
331 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
328 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3883  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
328 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  39.51 
 
 
331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  41.29 
 
 
491 aa  221  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  41.9 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  42.05 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3172  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  42.71 
 
 
335 aa  219  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  41.35 
 
 
333 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2012  aryl-alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
325 aa  219  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  41.67 
 
 
328 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
320 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  42.25 
 
 
342 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
327 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  38.86 
 
 
331 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  40.61 
 
 
325 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  42.2 
 
 
328 aa  217  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2860  aldo/keto reductase  39.51 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0184279  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  41.52 
 
 
329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  40.87 
 
 
327 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  41.9 
 
 
328 aa  215  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  43.31 
 
 
330 aa  215  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3695  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  39.86 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  40.91 
 
 
329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  41.46 
 
 
333 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  40 
 
 
334 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
327 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.96 
 
 
328 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4221  aldo/keto reductase  37.61 
 
 
390 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.886889  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  39.12 
 
 
326 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  39.1 
 
 
333 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  37.31 
 
 
327 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2612  aldo/keto reductase  38.55 
 
 
328 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  39.06 
 
 
327 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  40.55 
 
 
330 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0404  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
328 aa  208  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.34 
 
 
329 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  39.39 
 
 
329 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  41.1 
 
 
334 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
327 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
326 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
328 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  38.77 
 
 
334 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  39.38 
 
 
329 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  39.5 
 
 
327 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  39.63 
 
 
327 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  39.58 
 
 
331 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  38.56 
 
 
329 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  38.55 
 
 
331 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>