More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3883 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3883  aldo/keto reductase  100 
 
 		 328 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0302  aldo/keto reductase  59.88 
 
 		 334 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3695  aldo/keto reductase  60.37 
 
 		 332 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4441  aldo/keto reductase  53.75 
 
 		 341 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363717  normal  0.416804 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2025  aldo/keto reductase  55.39 
 
 		 334 aa  381  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3924  aldo/keto reductase  53.48 
 
 		 326 aa  363  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.281437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4371  aldo/keto reductase  53.02 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1438  aldo/keto reductase  53 
 
 		 333 aa  345  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.020448  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2860  aldo/keto reductase  49.09 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0184279  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3172  aldo/keto reductase  48.78 
 
 		 331 aa  315  7e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  48.46 
 
 		 333 aa  312  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  47.95 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  46.27 
 
 		 331 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  46.86 
 
 		 324 aa  299  5e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  46.58 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  44.41 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.25 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  47.17 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  44.95 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  44.69 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  43.83 
 
 		 328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  44.65 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  43.87 
 
 		 326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  44.21 
 
 		 328 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  43.9 
 
 		 328 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  44.07 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  45 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 326 aa  279  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  46.43 
 
 		 328 aa  279  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  43.12 
 
 		 328 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  44.51 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  43.71 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  44.14 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  45.05 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  42.95 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  44.2 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  44.82 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  44.82 
 
 		 328 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  44.24 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  44.83 
 
 		 328 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  43.52 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  43.69 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  46.58 
 
 		 449 aa  275  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1083  aryl-alcohol dehydrogenase  43.89 
 
 		 329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  42.46 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  45.45 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 329 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.51 
 
 		 329 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.51 
 
 		 329 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  41.56 
 
 		 335 aa  272  7e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.2 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  41.3 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 327 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  44.84 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  44.97 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  41.46 
 
 		 329 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  41.59 
 
 		 327 aa  268  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  41.85 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  45.48 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  43.61 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  42.94 
 
 		 334 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  43.08 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  42.45 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  39.81 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  43.56 
 
 		 332 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  41.64 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  42.72 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  43.57 
 
 		 342 aa  265  7e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3242  aldo/keto reductase  40.68 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  43.53 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  41.69 
 
 		 327 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  41.3 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2012  aryl-alcohol dehydrogenase  42.19 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  43.55 
 
 		 491 aa  262  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  41.74 
 
 		 328 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.68 
 
 		 327 aa  262  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  42.09 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  43.48 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  43.97 
 
 		 325 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  40.37 
 
 		 329 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  41.25 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  45.93 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  45.78 
 
 		 327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2873  hypothetical protein  43.34 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  40.37 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  39.26 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  41.59 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  42.99 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  45.31 
 
 		 329 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  40.18 
 
 		 335 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  41.27 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  41.75 
 
 		 340 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3488  putative aldo/keto reductase  40.56 
 
 		 332 aa  255  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0487962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  39.7 
 
 		 331 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  44.98 
 
 		 329 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.76 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  41.85 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  43.79 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>