More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3695 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3695  aldo/keto reductase  100 
 
 
332 aa  671    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0302  aldo/keto reductase  72.51 
 
 
334 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2025  aldo/keto reductase  69.16 
 
 
334 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3883  aldo/keto reductase  60.37 
 
 
328 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4441  aldo/keto reductase  60.36 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363717  normal  0.416804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3924  aldo/keto reductase  60.32 
 
 
326 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.281437  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4371  aldo/keto reductase  56.83 
 
 
324 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2860  aldo/keto reductase  58.72 
 
 
331 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0184279  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1438  aldo/keto reductase  57.99 
 
 
333 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.020448  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  54.4 
 
 
326 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  53.94 
 
 
324 aa  333  4e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3172  aldo/keto reductase  54.71 
 
 
331 aa  332  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  53.56 
 
 
333 aa  329  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  52.68 
 
 
328 aa  324  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  51.06 
 
 
331 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  54.52 
 
 
331 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  51.06 
 
 
328 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  51.52 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  49.09 
 
 
328 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  49.69 
 
 
327 aa  309  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  51.78 
 
 
327 aa  308  9e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  49.54 
 
 
330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  50.93 
 
 
326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  52.73 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  52.73 
 
 
340 aa  305  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  48.74 
 
 
317 aa  302  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  49.7 
 
 
331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  52.58 
 
 
328 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  50.61 
 
 
342 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  49.37 
 
 
327 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  48.48 
 
 
328 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  51.94 
 
 
327 aa  299  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  49.24 
 
 
330 aa  299  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  49.09 
 
 
331 aa  299  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  47.02 
 
 
327 aa  299  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  48.16 
 
 
329 aa  299  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  50.91 
 
 
326 aa  298  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  48.32 
 
 
329 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.04 
 
 
334 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  47.81 
 
 
335 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  46.91 
 
 
334 aa  296  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  48.17 
 
 
327 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  46.91 
 
 
335 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  47.58 
 
 
329 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  46.6 
 
 
334 aa  295  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  48.02 
 
 
330 aa  295  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  48.93 
 
 
333 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  49.09 
 
 
328 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  50 
 
 
328 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  47.72 
 
 
330 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  46.91 
 
 
334 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  46.18 
 
 
329 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  47.26 
 
 
329 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  49.24 
 
 
329 aa  290  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  47.56 
 
 
327 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  52.2 
 
 
338 aa  289  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.62 
 
 
327 aa  289  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  48.75 
 
 
331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  45.87 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  52.46 
 
 
325 aa  288  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  48.92 
 
 
327 aa  288  8e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  47.15 
 
 
328 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  49.37 
 
 
328 aa  288  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.81 
 
 
329 aa  288  9e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  50.8 
 
 
328 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  49.52 
 
 
331 aa  287  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  49.7 
 
 
328 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  50.65 
 
 
332 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  47.04 
 
 
331 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  43.35 
 
 
326 aa  286  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  50.47 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  49.53 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  45.59 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  51.1 
 
 
332 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.42 
 
 
329 aa  285  8e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.42 
 
 
329 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  47.42 
 
 
329 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  52.26 
 
 
329 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  47.83 
 
 
328 aa  285  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  46.53 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  47.42 
 
 
329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1083  aryl-alcohol dehydrogenase  44.66 
 
 
329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  47.17 
 
 
331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  49.39 
 
 
330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.8 
 
 
331 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2873  hypothetical protein  46.13 
 
 
336 aa  282  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  47.65 
 
 
331 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  51.61 
 
 
329 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0404  aldo/keto reductase  52.28 
 
 
328 aa  281  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  48.33 
 
 
334 aa  281  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3206  aldo/keto reductase  49.52 
 
 
325 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  49.07 
 
 
328 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  51.32 
 
 
328 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  48.72 
 
 
331 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
333 aa  280  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  53.46 
 
 
324 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  48.38 
 
 
309 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  48.43 
 
 
331 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  51.17 
 
 
325 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  47.2 
 
 
331 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>