More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2860 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2860  aldo/keto reductase  100 
 
 
331 aa  677    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0184279  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0302  aldo/keto reductase  57.4 
 
 
334 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2025  aldo/keto reductase  55.26 
 
 
334 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3924  aldo/keto reductase  54.55 
 
 
326 aa  348  7e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.281437  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3695  aldo/keto reductase  58.72 
 
 
332 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3172  aldo/keto reductase  54.27 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  54.23 
 
 
326 aa  329  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1438  aldo/keto reductase  53.77 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.020448  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4441  aldo/keto reductase  49.25 
 
 
341 aa  325  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363717  normal  0.416804 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  51.91 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3883  aldo/keto reductase  49.09 
 
 
328 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4371  aldo/keto reductase  53 
 
 
324 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  52.77 
 
 
309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  49.68 
 
 
317 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  51.53 
 
 
328 aa  305  9.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  48.77 
 
 
328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  50.16 
 
 
331 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  50.31 
 
 
340 aa  301  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  49.38 
 
 
333 aa  299  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  48 
 
 
331 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  48.41 
 
 
326 aa  297  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  50.8 
 
 
320 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  46.69 
 
 
328 aa  295  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  48.93 
 
 
327 aa  295  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  46.58 
 
 
326 aa  295  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  48.43 
 
 
328 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  51.28 
 
 
332 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
328 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  47.4 
 
 
331 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  48.57 
 
 
328 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  49.06 
 
 
360 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  46.46 
 
 
331 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  48.02 
 
 
329 aa  289  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  50 
 
 
330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  49.69 
 
 
328 aa  288  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  50.47 
 
 
449 aa  288  7e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  50.97 
 
 
332 aa  288  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  48.44 
 
 
328 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.4 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  47.13 
 
 
335 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  51.17 
 
 
325 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  47.08 
 
 
330 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0404  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  46.6 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  48.06 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  45.57 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  49.67 
 
 
491 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  46.62 
 
 
330 aa  282  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  48.43 
 
 
328 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  45.87 
 
 
330 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  45.87 
 
 
330 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  47.38 
 
 
328 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  45.26 
 
 
330 aa  279  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  49.51 
 
 
325 aa  278  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  49.22 
 
 
329 aa  278  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  46.82 
 
 
324 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  45.51 
 
 
328 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  48.89 
 
 
338 aa  276  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  46.08 
 
 
328 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  51.08 
 
 
330 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  51.15 
 
 
327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  44.62 
 
 
338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  49.01 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  46.2 
 
 
328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  45.06 
 
 
328 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  43.96 
 
 
327 aa  271  9e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  44.51 
 
 
331 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  49.03 
 
 
329 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  49.38 
 
 
327 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  47.81 
 
 
331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  47.81 
 
 
331 aa  268  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  45.82 
 
 
327 aa  268  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
327 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  49.12 
 
 
325 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  46.48 
 
 
331 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  48.38 
 
 
329 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1083  aryl-alcohol dehydrogenase  42.07 
 
 
329 aa  267  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2012  aryl-alcohol dehydrogenase  39.87 
 
 
325 aa  267  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  47.81 
 
 
330 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44 
 
 
327 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  45.03 
 
 
325 aa  266  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  45.95 
 
 
334 aa  265  8.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  45.51 
 
 
333 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  49.04 
 
 
324 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  43.5 
 
 
333 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  48.4 
 
 
320 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  41.95 
 
 
335 aa  263  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2873  hypothetical protein  42.94 
 
 
336 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  46.77 
 
 
334 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  42.59 
 
 
329 aa  261  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  43.4 
 
 
328 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  40.13 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  42.94 
 
 
329 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  42.59 
 
 
335 aa  258  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.02 
 
 
329 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.02 
 
 
329 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  42.02 
 
 
329 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
331 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2325  aldo/keto reductase  40.13 
 
 
336 aa  257  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>