More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0302 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0302  aldo/keto reductase  100 
 
 		 334 aa  686    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2025  aldo/keto reductase  79.04 
 
 		 334 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3695  aldo/keto reductase  72.51 
 
 		 332 aa  482  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4441  aldo/keto reductase  62.54 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363717  normal  0.416804 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3883  aldo/keto reductase  59.88 
 
 		 328 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3924  aldo/keto reductase  59.5 
 
 		 326 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.281437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2860  aldo/keto reductase  57.4 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0184279  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4371  aldo/keto reductase  54.29 
 
 		 324 aa  358  5e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1438  aldo/keto reductase  53.58 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.020448  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3172  aldo/keto reductase  54.98 
 
 		 331 aa  338  9e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  49.23 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  48.15 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  49.53 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  48.61 
 
 		 333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  48.49 
 
 		 328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  49.38 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  47.85 
 
 		 327 aa  308  8e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  48.19 
 
 		 330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  48.8 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  47.89 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  49.39 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  50.46 
 
 		 326 aa  301  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  46.85 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  49.7 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  46.3 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  48.34 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  46.22 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  46.13 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  46.93 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  45.2 
 
 		 331 aa  295  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.87 
 
 		 331 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  46.11 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  47.26 
 
 		 333 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  45.2 
 
 		 327 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  46.79 
 
 		 330 aa  291  8e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  44.95 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  48.1 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  46.91 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  44.04 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  46.83 
 
 		 360 aa  289  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  49.68 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.34 
 
 		 334 aa  288  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  45.48 
 
 		 330 aa  288  9e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  45.35 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  46.57 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  47.37 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.11 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  48.62 
 
 		 328 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  42.64 
 
 		 326 aa  286  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  44.11 
 
 		 327 aa  285  8e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  47.43 
 
 		 330 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  46.42 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  48.61 
 
 		 329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1160  aldo/keto reductase  42.41 
 
 		 382 aa  284  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0226313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  43.12 
 
 		 334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  43.38 
 
 		 329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  44.79 
 
 		 331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  43.9 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  43.65 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  44.88 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  45.81 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  46.99 
 
 		 327 aa  281  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  46.89 
 
 		 342 aa  281  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  46.53 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  45.81 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2873  hypothetical protein  43.81 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  47.99 
 
 		 329 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  44.95 
 
 		 331 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  51.53 
 
 		 327 aa  279  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  50 
 
 		 332 aa  278  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  47.9 
 
 		 309 aa  278  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  42.9 
 
 		 334 aa  278  8e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  47.83 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0404  aldo/keto reductase  49.1 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  46.75 
 
 		 329 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  49.03 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  42.47 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.2 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.2 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  44.72 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  43.2 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  47.19 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3244  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.667963  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  44.41 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  44.92 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  41.87 
 
 		 329 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  46.56 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  42.17 
 
 		 327 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  45.6 
 
 		 491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  48.6 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32530  Aldo/keto reductase protein  44.72 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  42.17 
 
 		 329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  44.21 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  48.51 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  46.42 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  41.23 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.16 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  47.42 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>