More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3183 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3183  aldo/keto reductase  100 
 
 		 330 aa  683    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  44.11 
 
 		 491 aa  279  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  44.79 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  43.81 
 
 		 328 aa  276  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  44.81 
 
 		 332 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  44.71 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  46.11 
 
 		 331 aa  271  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  42.94 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  44.73 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  44.14 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  43.11 
 
 		 331 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  44.71 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  46.04 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  43.37 
 
 		 330 aa  262  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  43.98 
 
 		 328 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  43.37 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  45.43 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  43.07 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  44.24 
 
 		 327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  42.6 
 
 		 328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.73 
 
 		 331 aa  258  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  42.73 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  42.6 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  43.5 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  43.2 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  44.64 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  42.94 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  42.09 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  41.27 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  43.9 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  41.12 
 
 		 334 aa  251  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  43.25 
 
 		 329 aa  251  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  41.99 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  42.04 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  42.6 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  42.34 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  43.69 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  43.45 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  41.49 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4943  aldo/keto reductase  41.27 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  42.51 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  41.99 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  42.15 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  42.5 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  41.09 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  42.43 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  40.84 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  40.5 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2317  aldo/keto reductase  41.14 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  42.77 
 
 		 449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2325  aldo/keto reductase  38.69 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  40.84 
 
 		 331 aa  238  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3488  putative aldo/keto reductase  41.62 
 
 		 332 aa  238  8e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0487962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  41.69 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  41.95 
 
 		 329 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  39.05 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  40.72 
 
 		 339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  41.39 
 
 		 328 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  41.12 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  41.1 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  37.95 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3883  aldo/keto reductase  42.11 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2873  hypothetical protein  42.69 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0404  aldo/keto reductase  43.2 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  39.35 
 
 		 309 aa  229  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  42.34 
 
 		 327 aa  228  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  39.68 
 
 		 326 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  40.49 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  42.07 
 
 		 334 aa  225  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2025  aldo/keto reductase  41.1 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  40.84 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  39.22 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0302  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721467  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  38.02 
 
 		 329 aa  222  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  39.16 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  38.02 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  39.53 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  40.62 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.02 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  37.72 
 
 		 329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3242  aldo/keto reductase  38.55 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  38.02 
 
 		 329 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4441  aldo/keto reductase  38.53 
 
 		 341 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363717  normal  0.416804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  37.13 
 
 		 331 aa  218  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3924  aldo/keto reductase  39.31 
 
 		 326 aa  218  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.281437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.69 
 
 		 334 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3748  aldo/keto reductase  41.96 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  36.45 
 
 		 331 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3695  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  39.56 
 
 		 330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.02 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.02 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  38.86 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  38.02 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.05 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>