More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4981 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4981  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  100 
 
 		 271 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  92.99 
 
 		 271 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  83.52 
 
 		 270 aa  460  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4932  aldo/keto reductase  79.78 
 
 		 270 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4981  aldo/keto reductase  79.78 
 
 		 270 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4804  aldo/keto reductase  79.78 
 
 		 270 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44630  Aldo/keto reductase family protein  79.03 
 
 		 272 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0940461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0534  aldo/keto reductase  77.9 
 
 		 270 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.043929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0615  aldo/keto reductase  80.16 
 
 		 270 aa  418  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66010  hypothetical protein  76.03 
 
 		 270 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0637322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5727  hypothetical protein  75.28 
 
 		 270 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1959  aldo/keto reductase  42.98 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  39.91 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  30.82 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4912  aldo/keto reductase  32.4 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  31.43 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  34.51 
 
 		 329 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  36.36 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  38.25 
 
 		 325 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  30.87 
 
 		 314 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  34.54 
 
 		 336 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  28.96 
 
 		 317 aa  96.3  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  33.64 
 
 		 312 aa  95.9  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  33.64 
 
 		 312 aa  95.9  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  32.42 
 
 		 339 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  32.42 
 
 		 339 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  32.42 
 
 		 339 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  31.16 
 
 		 319 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  34.22 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  34.78 
 
 		 341 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  30.23 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2667  aldo/keto reductase  35.94 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.804175  normal  0.0176186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  31.01 
 
 		 343 aa  92.8  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  29.21 
 
 		 350 aa  92  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  33.48 
 
 		 327 aa  92  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  37.07 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  32.13 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  31.16 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4507  oxidoreductase (related to aryl-alcohol dehydrogenase)-like protein  35.37 
 
 		 431 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0885  aldo/keto reductase  39.29 
 
 		 341 aa  91.3  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  31.91 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3198  aldo/keto reductase  35.19 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  33.63 
 
 		 317 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  30.36 
 
 		 309 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.64 
 
 		 312 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  33.77 
 
 		 338 aa  89.7  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  34.78 
 
 		 337 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0341  aldo/keto reductase  30.25 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000752262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  36.02 
 
 		 342 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  31.94 
 
 		 330 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  31.39 
 
 		 355 aa  89.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 317 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  30.34 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.49 
 
 		 335 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.49 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  32.29 
 
 		 332 aa  88.6  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  32.39 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  33.54 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0370  aldo/keto reductase  33.19 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  33.01 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  30.77 
 
 		 342 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  36.99 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  26.87 
 
 		 312 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  34.84 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  32.58 
 
 		 368 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1182  aldo/keto reductase  38.24 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  31.76 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  36.16 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  27.12 
 
 		 351 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  36.97 
 
 		 368 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  28.47 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  31.39 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  30.94 
 
 		 336 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  26.58 
 
 		 334 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.1 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.1 
 
 		 311 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  32.89 
 
 		 351 aa  87  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0821  aldo/keto reductase  33.64 
 
 		 327 aa  86.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146536 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  30.73 
 
 		 337 aa  86.7  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  33.03 
 
 		 334 aa  86.3  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.01 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.01 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  29.77 
 
 		 328 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2035  aldo/keto reductase  29.08 
 
 		 341 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  hitchhiker  0.000622322 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.01 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  28.66 
 
 		 343 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  32.09 
 
 		 328 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1755  aldo/keto reductase  30.16 
 
 		 323 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000557671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  32.92 
 
 		 337 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  26.91 
 
 		 306 aa  85.9  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  35.61 
 
 		 329 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  35.12 
 
 		 329 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  31.54 
 
 		 325 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2301  aldo/keto reductase  37.5 
 
 		 332 aa  85.5  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.01 
 
 		 311 aa  85.5  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  34 
 
 		 311 aa  85.5  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  32.75 
 
 		 331 aa  85.5  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1405  aldo/keto reductase  30.61 
 
 		 326 aa  85.5  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.54 
 
 		 311 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  30.23 
 
 		 328 aa  85.5  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>