More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03262 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  100 
 
 
348 aa  688    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  43.24 
 
 
346 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  46.13 
 
 
338 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.44 
 
 
323 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  40.06 
 
 
338 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  39.47 
 
 
338 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  44.44 
 
 
346 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  41.27 
 
 
339 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.14 
 
 
346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  46.25 
 
 
334 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.36 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  43.96 
 
 
323 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  42.07 
 
 
354 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
341 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  47.66 
 
 
314 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.12 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  46.28 
 
 
313 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  41.09 
 
 
334 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  41.79 
 
 
340 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  44.75 
 
 
329 aa  236  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.37 
 
 
341 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  40.35 
 
 
334 aa  232  9e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.45 
 
 
348 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  45.15 
 
 
338 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  45.15 
 
 
338 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  41.67 
 
 
328 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.85 
 
 
338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.21 
 
 
334 aa  225  9e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
334 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  39.77 
 
 
343 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  50.97 
 
 
309 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  39.21 
 
 
340 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  40 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  44.74 
 
 
333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  39 
 
 
352 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  42.32 
 
 
322 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.14 
 
 
321 aa  215  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.54 
 
 
373 aa  215  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.64 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  42.51 
 
 
326 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  38.37 
 
 
339 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  40.85 
 
 
334 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
334 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  37.2 
 
 
336 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  38.37 
 
 
339 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  38.37 
 
 
339 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  36.36 
 
 
336 aa  202  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  37.46 
 
 
337 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.06 
 
 
336 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.06 
 
 
336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.06 
 
 
336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  38.91 
 
 
339 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.06 
 
 
336 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  37.76 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  36.06 
 
 
336 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.42 
 
 
336 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.42 
 
 
336 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  37.15 
 
 
308 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  35.26 
 
 
339 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  38.1 
 
 
332 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.36 
 
 
345 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.13 
 
 
350 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  31.54 
 
 
312 aa  155  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  31.29 
 
 
378 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  32.08 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  32.68 
 
 
356 aa  143  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  30.03 
 
 
395 aa  143  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
317 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  32.2 
 
 
316 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.28 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  32.72 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  31.17 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  33.02 
 
 
309 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  29.79 
 
 
319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  26.99 
 
 
322 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  26.81 
 
 
412 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
325 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  27.16 
 
 
326 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  28.08 
 
 
306 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  27.19 
 
 
312 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  29.19 
 
 
326 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  27.76 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  26.86 
 
 
332 aa  95.9  9e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.63 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.32 
 
 
308 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3281  aldo/keto reductase  29 
 
 
351 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1876  aldo/keto reductase  32.81 
 
 
317 aa  92.8  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0609138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4165  lolS protein  24.62 
 
 
304 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4229  lolS protein  25.62 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  37.14 
 
 
333 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1455  aldo/keto reductase  25.96 
 
 
298 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  26.88 
 
 
319 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4005  lolS protein  25.32 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3838  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.32 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4120  lolS protein  25.32 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000109156 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4318  oxidoreductase  25.32 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  25.25 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.25 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  28.75 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  25 
 
 
304 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>