More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1644 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  100 
 
 		 323 aa  673    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  43.31 
 
 		 317 aa  288  8e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  43.39 
 
 		 312 aa  271  9e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  32.23 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.5 
 
 		 339 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  28.57 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  29.81 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  31.72 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  32.55 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  32.08 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  31.94 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  32.85 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  31.51 
 
 		 316 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09457  conserved hypothetical protein  31.03 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0221624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  33.67 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  30.15 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  30.6 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  31.75 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  33.45 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07621  L-galactose dehydrogenase (L-GalDH), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04140)  32.62 
 
 		 459 aa  129  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  32.29 
 
 		 321 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  28.83 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.93 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  30.29 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  33.7 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  31.68 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.15 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  27.02 
 
 		 339 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04250  expressed protein  33.33 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.144806  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  30.93 
 
 		 334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.53 
 
 		 346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  32.32 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58212  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  31.37 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  29.32 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  27.96 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  26.73 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  29.77 
 
 		 340 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  28.66 
 
 		 342 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  28.53 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  25.59 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  29.35 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2826  aldo/keto reductase  33.62 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  31.25 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6932  aldo/keto reductase  29.69 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  28.39 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  30.52 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.38 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  30.38 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.14 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  26.19 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  26.13 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  30.74 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.16 
 
 		 339 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  25.58 
 
 		 338 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  29.41 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  24.84 
 
 		 338 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2469  aldo/keto reductase  31.05 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 326 aa  108  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  25.69 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1687  aldo/keto reductase  27.81 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  30.12 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  31.31 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  26.96 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  29.14 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1722  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.24 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0414871  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1650  aldo/keto reductase  30.24 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.24 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  27.81 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  28.26 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  26.79 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3566  aldo/keto reductase  27.27 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  28.09 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  34.8 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  30.92 
 
 		 344 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  30.21 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  29.28 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1969  putative oxidoreductase  27.85 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365702  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  30.92 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  29.28 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1418  aldo/keto reductase  28.18 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  26.54 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  29 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  26.15 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.25 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  28.81 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  35.37 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  32.07 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  24.84 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.62 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  29.51 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  32.64 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  27.72 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  27.21 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  28.09 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  32.51 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0379  aldo/keto reductase  27.33 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0161187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  28.04 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  27.74 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  29.25 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  27.33 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>