More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1823 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  100 
 
 
328 aa  662    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  53.05 
 
 
334 aa  334  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  47.09 
 
 
338 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  48.8 
 
 
346 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.87 
 
 
338 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.9 
 
 
346 aa  291  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  45.35 
 
 
339 aa  291  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  50.16 
 
 
314 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  48.8 
 
 
346 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  47.35 
 
 
334 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  46.53 
 
 
340 aa  279  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.5 
 
 
339 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  45.9 
 
 
338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  50.62 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.26 
 
 
338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.74 
 
 
341 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.03 
 
 
323 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.34 
 
 
323 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  46.2 
 
 
329 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  44.14 
 
 
354 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
341 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  45.91 
 
 
328 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.19 
 
 
321 aa  262  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  47.5 
 
 
326 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.96 
 
 
352 aa  255  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  42.73 
 
 
343 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  47.58 
 
 
338 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  47.58 
 
 
338 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  47.27 
 
 
338 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  47.81 
 
 
345 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.14 
 
 
334 aa  248  9e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  43.77 
 
 
340 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  44.04 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  45.6 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  42.01 
 
 
336 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  42.01 
 
 
336 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.3 
 
 
336 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.3 
 
 
336 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  42.01 
 
 
336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.24 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.44 
 
 
339 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.72 
 
 
336 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.72 
 
 
336 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.72 
 
 
336 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  44.87 
 
 
322 aa  238  8e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.79 
 
 
339 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.65 
 
 
336 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  39.76 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.85 
 
 
334 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  44.85 
 
 
334 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.38 
 
 
373 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  42.44 
 
 
332 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40 
 
 
350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
339 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
339 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.68 
 
 
339 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.9 
 
 
337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  40.54 
 
 
378 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  37.78 
 
 
308 aa  219  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  41.67 
 
 
348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.04 
 
 
348 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  38.73 
 
 
322 aa  209  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  49.29 
 
 
309 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  38.77 
 
 
395 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  34.91 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  35.19 
 
 
323 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  33.54 
 
 
356 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  31.27 
 
 
319 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  36.42 
 
 
299 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  29.97 
 
 
322 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  34.81 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  33.55 
 
 
317 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  29.97 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  27.48 
 
 
312 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  27.96 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  29.87 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  29.39 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  30.82 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0370  aldo/keto reductase  32.15 
 
 
328 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  30.67 
 
 
327 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  25.24 
 
 
326 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  27.24 
 
 
309 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0842  aryl-alcohol dehydrogenase  25.99 
 
 
302 aa  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.53 
 
 
312 aa  106  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  30.19 
 
 
331 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  30.19 
 
 
412 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  28.39 
 
 
319 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  27.24 
 
 
311 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  27.96 
 
 
305 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  28.66 
 
 
312 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  28.66 
 
 
312 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
331 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  27.1 
 
 
328 aa  102  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  29.75 
 
 
314 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  28.43 
 
 
304 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  27.47 
 
 
318 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
306 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.64 
 
 
311 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.96 
 
 
327 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.75 
 
 
311 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>